Protein–RNA interactions for Protein: Q96DD7

SHISA4, Protein shisa-4, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHISA4Q96DD7 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SHISA4Q96DD7 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SHISA4Q96DD7 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SHISA4Q96DD7 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SHISA4Q96DD7 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SHISA4Q96DD7 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SHISA4Q96DD7 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SHISA4Q96DD7 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SHISA4Q96DD7 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SHISA4Q96DD7 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SHISA4Q96DD7 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SHISA4Q96DD7 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SHISA4Q96DD7 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SHISA4Q96DD7 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SHISA4Q96DD7 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SHISA4Q96DD7 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SHISA4Q96DD7 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SHISA4Q96DD7 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SHISA4Q96DD7 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SHISA4Q96DD7 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SHISA4Q96DD7 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SHISA4Q96DD7 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SHISA4Q96DD7 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SHISA4Q96DD7 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SHISA4Q96DD7 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SHISA4Q96DD7 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SHISA4Q96DD7 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SHISA4Q96DD7 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SHISA4Q96DD7 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SHISA4Q96DD7 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SHISA4Q96DD7 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SHISA4Q96DD7 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SHISA4Q96DD7 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SHISA4Q96DD7 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SHISA4Q96DD7 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SHISA4Q96DD7 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SHISA4Q96DD7 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SHISA4Q96DD7 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SHISA4Q96DD7 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SHISA4Q96DD7 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SHISA4Q96DD7 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SHISA4Q96DD7 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SHISA4Q96DD7 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SHISA4Q96DD7 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SHISA4Q96DD7 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SHISA4Q96DD7 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SHISA4Q96DD7 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SHISA4Q96DD7 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SHISA4Q96DD7 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SHISA4Q96DD7 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SHISA4Q96DD7 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SHISA4Q96DD7 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SHISA4Q96DD7 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SHISA4Q96DD7 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SHISA4Q96DD7 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SHISA4Q96DD7 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SHISA4Q96DD7 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SHISA4Q96DD7 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SHISA4Q96DD7 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SHISA4Q96DD7 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SHISA4Q96DD7 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SHISA4Q96DD7 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SHISA4Q96DD7 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SHISA4Q96DD7 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
SHISA4Q96DD7 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SHISA4Q96DD7 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SHISA4Q96DD7 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SHISA4Q96DD7 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SHISA4Q96DD7 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SHISA4Q96DD7 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SHISA4Q96DD7 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SHISA4Q96DD7 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SHISA4Q96DD7 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SHISA4Q96DD7 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SHISA4Q96DD7 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SHISA4Q96DD7 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SHISA4Q96DD7 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SHISA4Q96DD7 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SHISA4Q96DD7 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SHISA4Q96DD7 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SHISA4Q96DD7 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SHISA4Q96DD7 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SHISA4Q96DD7 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SHISA4Q96DD7 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SHISA4Q96DD7 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SHISA4Q96DD7 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SHISA4Q96DD7 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SHISA4Q96DD7 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SHISA4Q96DD7 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SHISA4Q96DD7 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SHISA4Q96DD7 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SHISA4Q96DD7 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SHISA4Q96DD7 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SHISA4Q96DD7 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SHISA4Q96DD7 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SHISA4Q96DD7 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SHISA4Q96DD7 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SHISA4Q96DD7 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SHISA4Q96DD7 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SHISA4Q96DD7 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms