Protein–RNA interactions for Protein: Q96CN9

GCC1, GRIP and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCC1Q96CN9 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GCC1Q96CN9 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
GCC1Q96CN9 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
GCC1Q96CN9 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
GCC1Q96CN9 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GCC1Q96CN9 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GCC1Q96CN9 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GCC1Q96CN9 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GCC1Q96CN9 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
GCC1Q96CN9 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GCC1Q96CN9 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GCC1Q96CN9 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GCC1Q96CN9 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GCC1Q96CN9 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GCC1Q96CN9 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GCC1Q96CN9 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
GCC1Q96CN9 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GCC1Q96CN9 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
GCC1Q96CN9 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GCC1Q96CN9 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
GCC1Q96CN9 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
GCC1Q96CN9 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
GCC1Q96CN9 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
GCC1Q96CN9 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
GCC1Q96CN9 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
GCC1Q96CN9 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
GCC1Q96CN9 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
GCC1Q96CN9 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
GCC1Q96CN9 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
GCC1Q96CN9 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
GCC1Q96CN9 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
GCC1Q96CN9 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
GCC1Q96CN9 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
GCC1Q96CN9 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
GCC1Q96CN9 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
GCC1Q96CN9 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
GCC1Q96CN9 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
GCC1Q96CN9 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
GCC1Q96CN9 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
GCC1Q96CN9 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GCC1Q96CN9 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
GCC1Q96CN9 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
GCC1Q96CN9 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
GCC1Q96CN9 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
GCC1Q96CN9 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GCC1Q96CN9 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GCC1Q96CN9 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
GCC1Q96CN9 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GCC1Q96CN9 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GCC1Q96CN9 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GCC1Q96CN9 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GCC1Q96CN9 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
GCC1Q96CN9 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GCC1Q96CN9 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
GCC1Q96CN9 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GCC1Q96CN9 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GCC1Q96CN9 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GCC1Q96CN9 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
GCC1Q96CN9 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GCC1Q96CN9 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GCC1Q96CN9 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
GCC1Q96CN9 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
GCC1Q96CN9 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GCC1Q96CN9 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GCC1Q96CN9 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
GCC1Q96CN9 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GCC1Q96CN9 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GCC1Q96CN9 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GCC1Q96CN9 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GCC1Q96CN9 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GCC1Q96CN9 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
GCC1Q96CN9 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GCC1Q96CN9 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GCC1Q96CN9 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
GCC1Q96CN9 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
GCC1Q96CN9 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GCC1Q96CN9 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GCC1Q96CN9 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GCC1Q96CN9 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
GCC1Q96CN9 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
GCC1Q96CN9 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
GCC1Q96CN9 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
GCC1Q96CN9 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
GCC1Q96CN9 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
GCC1Q96CN9 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
GCC1Q96CN9 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
GCC1Q96CN9 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
GCC1Q96CN9 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
GCC1Q96CN9 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GCC1Q96CN9 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GCC1Q96CN9 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GCC1Q96CN9 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GCC1Q96CN9 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GCC1Q96CN9 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GCC1Q96CN9 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
GCC1Q96CN9 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
GCC1Q96CN9 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
GCC1Q96CN9 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
GCC1Q96CN9 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GCC1Q96CN9 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms