Protein–RNA interactions for Protein: Q96CE8

TM4SF18, Transmembrane 4 L6 family member 18, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF18Q96CE8 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TM4SF18Q96CE8 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TM4SF18Q96CE8 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TM4SF18Q96CE8 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
TM4SF18Q96CE8 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TM4SF18Q96CE8 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TM4SF18Q96CE8 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TM4SF18Q96CE8 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TM4SF18Q96CE8 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TM4SF18Q96CE8 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TM4SF18Q96CE8 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TM4SF18Q96CE8 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TM4SF18Q96CE8 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TM4SF18Q96CE8 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TM4SF18Q96CE8 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TM4SF18Q96CE8 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TM4SF18Q96CE8 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TM4SF18Q96CE8 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TM4SF18Q96CE8 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TM4SF18Q96CE8 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TM4SF18Q96CE8 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TM4SF18Q96CE8 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TM4SF18Q96CE8 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TM4SF18Q96CE8 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TM4SF18Q96CE8 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TM4SF18Q96CE8 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TM4SF18Q96CE8 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TM4SF18Q96CE8 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TM4SF18Q96CE8 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TM4SF18Q96CE8 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TM4SF18Q96CE8 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TM4SF18Q96CE8 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TM4SF18Q96CE8 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TM4SF18Q96CE8 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TM4SF18Q96CE8 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
TM4SF18Q96CE8 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TM4SF18Q96CE8 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TM4SF18Q96CE8 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TM4SF18Q96CE8 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TM4SF18Q96CE8 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
TM4SF18Q96CE8 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TM4SF18Q96CE8 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TM4SF18Q96CE8 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TM4SF18Q96CE8 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TM4SF18Q96CE8 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TM4SF18Q96CE8 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TM4SF18Q96CE8 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
TM4SF18Q96CE8 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TM4SF18Q96CE8 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TM4SF18Q96CE8 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
TM4SF18Q96CE8 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TM4SF18Q96CE8 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TM4SF18Q96CE8 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TM4SF18Q96CE8 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TM4SF18Q96CE8 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TM4SF18Q96CE8 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TM4SF18Q96CE8 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TM4SF18Q96CE8 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TM4SF18Q96CE8 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TM4SF18Q96CE8 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TM4SF18Q96CE8 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TM4SF18Q96CE8 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TM4SF18Q96CE8 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TM4SF18Q96CE8 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TM4SF18Q96CE8 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TM4SF18Q96CE8 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TM4SF18Q96CE8 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TM4SF18Q96CE8 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TM4SF18Q96CE8 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TM4SF18Q96CE8 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TM4SF18Q96CE8 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TM4SF18Q96CE8 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TM4SF18Q96CE8 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TM4SF18Q96CE8 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TM4SF18Q96CE8 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TM4SF18Q96CE8 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TM4SF18Q96CE8 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TM4SF18Q96CE8 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
TM4SF18Q96CE8 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TM4SF18Q96CE8 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TM4SF18Q96CE8 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TM4SF18Q96CE8 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TM4SF18Q96CE8 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TM4SF18Q96CE8 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TM4SF18Q96CE8 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TM4SF18Q96CE8 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TM4SF18Q96CE8 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
TM4SF18Q96CE8 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TM4SF18Q96CE8 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TM4SF18Q96CE8 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TM4SF18Q96CE8 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
TM4SF18Q96CE8 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
TM4SF18Q96CE8 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TM4SF18Q96CE8 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TM4SF18Q96CE8 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TM4SF18Q96CE8 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TM4SF18Q96CE8 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TM4SF18Q96CE8 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TM4SF18Q96CE8 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TM4SF18Q96CE8 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms