Protein–RNA interactions for Protein: Q96AW1

VOPP1, Vesicular, overexpressed in cancer, prosurvival protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VOPP1Q96AW1 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
VOPP1Q96AW1 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
VOPP1Q96AW1 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
VOPP1Q96AW1 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VOPP1Q96AW1 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
VOPP1Q96AW1 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VOPP1Q96AW1 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
VOPP1Q96AW1 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VOPP1Q96AW1 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
VOPP1Q96AW1 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
VOPP1Q96AW1 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VOPP1Q96AW1 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VOPP1Q96AW1 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VOPP1Q96AW1 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VOPP1Q96AW1 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VOPP1Q96AW1 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VOPP1Q96AW1 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
VOPP1Q96AW1 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
VOPP1Q96AW1 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
VOPP1Q96AW1 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
VOPP1Q96AW1 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
VOPP1Q96AW1 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
VOPP1Q96AW1 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
VOPP1Q96AW1 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
VOPP1Q96AW1 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
VOPP1Q96AW1 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VOPP1Q96AW1 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VOPP1Q96AW1 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VOPP1Q96AW1 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VOPP1Q96AW1 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VOPP1Q96AW1 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
VOPP1Q96AW1 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
VOPP1Q96AW1 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
VOPP1Q96AW1 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VOPP1Q96AW1 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VOPP1Q96AW1 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
VOPP1Q96AW1 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
VOPP1Q96AW1 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VOPP1Q96AW1 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VOPP1Q96AW1 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
VOPP1Q96AW1 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VOPP1Q96AW1 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
VOPP1Q96AW1 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
VOPP1Q96AW1 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
VOPP1Q96AW1 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VOPP1Q96AW1 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VOPP1Q96AW1 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
VOPP1Q96AW1 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
VOPP1Q96AW1 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VOPP1Q96AW1 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
VOPP1Q96AW1 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
VOPP1Q96AW1 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VOPP1Q96AW1 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VOPP1Q96AW1 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
VOPP1Q96AW1 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VOPP1Q96AW1 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
VOPP1Q96AW1 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
VOPP1Q96AW1 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VOPP1Q96AW1 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VOPP1Q96AW1 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
VOPP1Q96AW1 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VOPP1Q96AW1 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VOPP1Q96AW1 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VOPP1Q96AW1 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VOPP1Q96AW1 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
VOPP1Q96AW1 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VOPP1Q96AW1 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VOPP1Q96AW1 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
VOPP1Q96AW1 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
VOPP1Q96AW1 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
VOPP1Q96AW1 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
VOPP1Q96AW1 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
VOPP1Q96AW1 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
VOPP1Q96AW1 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
VOPP1Q96AW1 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
VOPP1Q96AW1 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
VOPP1Q96AW1 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
VOPP1Q96AW1 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VOPP1Q96AW1 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
VOPP1Q96AW1 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
VOPP1Q96AW1 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
VOPP1Q96AW1 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VOPP1Q96AW1 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VOPP1Q96AW1 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
VOPP1Q96AW1 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
VOPP1Q96AW1 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
VOPP1Q96AW1 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
VOPP1Q96AW1 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
VOPP1Q96AW1 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VOPP1Q96AW1 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VOPP1Q96AW1 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
VOPP1Q96AW1 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VOPP1Q96AW1 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VOPP1Q96AW1 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VOPP1Q96AW1 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
VOPP1Q96AW1 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VOPP1Q96AW1 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VOPP1Q96AW1 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
VOPP1Q96AW1 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VOPP1Q96AW1 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms