Protein–RNA interactions for Protein: Q92786

PROX1, Prospero homeobox protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 737 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROX1Q92786 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PROX1Q92786 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PROX1Q92786 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PROX1Q92786 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PROX1Q92786 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PROX1Q92786 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PROX1Q92786 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PROX1Q92786 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PROX1Q92786 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PROX1Q92786 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PROX1Q92786 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PROX1Q92786 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PROX1Q92786 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PROX1Q92786 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PROX1Q92786 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PROX1Q92786 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PROX1Q92786 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PROX1Q92786 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PROX1Q92786 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PROX1Q92786 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PROX1Q92786 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PROX1Q92786 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PROX1Q92786 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PROX1Q92786 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PROX1Q92786 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PROX1Q92786 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PROX1Q92786 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PROX1Q92786 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PROX1Q92786 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PROX1Q92786 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PROX1Q92786 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PROX1Q92786 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PROX1Q92786 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PROX1Q92786 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PROX1Q92786 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PROX1Q92786 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PROX1Q92786 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PROX1Q92786 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PROX1Q92786 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PROX1Q92786 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PROX1Q92786 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PROX1Q92786 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PROX1Q92786 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PROX1Q92786 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PROX1Q92786 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PROX1Q92786 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PROX1Q92786 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PROX1Q92786 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PROX1Q92786 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PROX1Q92786 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PROX1Q92786 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PROX1Q92786 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PROX1Q92786 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PROX1Q92786 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PROX1Q92786 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PROX1Q92786 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PROX1Q92786 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PROX1Q92786 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PROX1Q92786 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PROX1Q92786 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PROX1Q92786 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PROX1Q92786 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PROX1Q92786 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PROX1Q92786 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PROX1Q92786 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PROX1Q92786 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PROX1Q92786 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PROX1Q92786 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PROX1Q92786 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PROX1Q92786 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PROX1Q92786 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PROX1Q92786 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PROX1Q92786 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PROX1Q92786 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PROX1Q92786 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PROX1Q92786 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PROX1Q92786 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PROX1Q92786 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PROX1Q92786 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PROX1Q92786 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PROX1Q92786 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PROX1Q92786 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PROX1Q92786 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PROX1Q92786 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PROX1Q92786 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PROX1Q92786 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PROX1Q92786 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PROX1Q92786 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PROX1Q92786 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PROX1Q92786 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PROX1Q92786 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PROX1Q92786 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PROX1Q92786 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PROX1Q92786 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PROX1Q92786 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PROX1Q92786 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PROX1Q92786 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PROX1Q92786 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PROX1Q92786 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PROX1Q92786 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms