Protein–RNA interactions for Protein: Q92766

RREB1, Ras-responsive element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RREB1Q92766 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RREB1Q92766 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RREB1Q92766 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RREB1Q92766 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RREB1Q92766 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
RREB1Q92766 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
RREB1Q92766 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RREB1Q92766 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RREB1Q92766 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RREB1Q92766 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RREB1Q92766 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RREB1Q92766 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RREB1Q92766 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RREB1Q92766 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RREB1Q92766 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RREB1Q92766 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RREB1Q92766 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
RREB1Q92766 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RREB1Q92766 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RREB1Q92766 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RREB1Q92766 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RREB1Q92766 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RREB1Q92766 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
RREB1Q92766 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
RREB1Q92766 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
RREB1Q92766 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.11
RREB1Q92766 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.11
RREB1Q92766 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
RREB1Q92766 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
RREB1Q92766 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
RREB1Q92766 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
RREB1Q92766 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
RREB1Q92766 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RREB1Q92766 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RREB1Q92766 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RREB1Q92766 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RREB1Q92766 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RREB1Q92766 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RREB1Q92766 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RREB1Q92766 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RREB1Q92766 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RREB1Q92766 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RREB1Q92766 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RREB1Q92766 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RREB1Q92766 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RREB1Q92766 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RREB1Q92766 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RREB1Q92766 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RREB1Q92766 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RREB1Q92766 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RREB1Q92766 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
RREB1Q92766 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RREB1Q92766 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RREB1Q92766 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RREB1Q92766 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RREB1Q92766 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RREB1Q92766 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
RREB1Q92766 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RREB1Q92766 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RREB1Q92766 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
RREB1Q92766 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
RREB1Q92766 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RREB1Q92766 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
RREB1Q92766 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RREB1Q92766 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RREB1Q92766 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RREB1Q92766 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RREB1Q92766 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RREB1Q92766 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RREB1Q92766 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
RREB1Q92766 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RREB1Q92766 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
RREB1Q92766 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RREB1Q92766 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
RREB1Q92766 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RREB1Q92766 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RREB1Q92766 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RREB1Q92766 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RREB1Q92766 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RREB1Q92766 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
RREB1Q92766 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
RREB1Q92766 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
RREB1Q92766 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
RREB1Q92766 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RREB1Q92766 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
RREB1Q92766 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RREB1Q92766 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RREB1Q92766 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
RREB1Q92766 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RREB1Q92766 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RREB1Q92766 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RREB1Q92766 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RREB1Q92766 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RREB1Q92766 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RREB1Q92766 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RREB1Q92766 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RREB1Q92766 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
RREB1Q92766 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RREB1Q92766 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RREB1Q92766 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127 ms