Protein–RNA interactions for Protein: Q92576

PHF3, PHD finger protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF3Q92576 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PHF3Q92576 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PHF3Q92576 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PHF3Q92576 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PHF3Q92576 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PHF3Q92576 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PHF3Q92576 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PHF3Q92576 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PHF3Q92576 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PHF3Q92576 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PHF3Q92576 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PHF3Q92576 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PHF3Q92576 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PHF3Q92576 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PHF3Q92576 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PHF3Q92576 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PHF3Q92576 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PHF3Q92576 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PHF3Q92576 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PHF3Q92576 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PHF3Q92576 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PHF3Q92576 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PHF3Q92576 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PHF3Q92576 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PHF3Q92576 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PHF3Q92576 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PHF3Q92576 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PHF3Q92576 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PHF3Q92576 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PHF3Q92576 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PHF3Q92576 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
PHF3Q92576 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PHF3Q92576 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PHF3Q92576 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PHF3Q92576 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PHF3Q92576 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PHF3Q92576 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PHF3Q92576 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
PHF3Q92576 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
PHF3Q92576 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
PHF3Q92576 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PHF3Q92576 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PHF3Q92576 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PHF3Q92576 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PHF3Q92576 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PHF3Q92576 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PHF3Q92576 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PHF3Q92576 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PHF3Q92576 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PHF3Q92576 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PHF3Q92576 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PHF3Q92576 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PHF3Q92576 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PHF3Q92576 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PHF3Q92576 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PHF3Q92576 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PHF3Q92576 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PHF3Q92576 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
PHF3Q92576 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PHF3Q92576 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PHF3Q92576 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PHF3Q92576 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PHF3Q92576 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
PHF3Q92576 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PHF3Q92576 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PHF3Q92576 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PHF3Q92576 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PHF3Q92576 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PHF3Q92576 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PHF3Q92576 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PHF3Q92576 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PHF3Q92576 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PHF3Q92576 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PHF3Q92576 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PHF3Q92576 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PHF3Q92576 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PHF3Q92576 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PHF3Q92576 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PHF3Q92576 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PHF3Q92576 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PHF3Q92576 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PHF3Q92576 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PHF3Q92576 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PHF3Q92576 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PHF3Q92576 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PHF3Q92576 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PHF3Q92576 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PHF3Q92576 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PHF3Q92576 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PHF3Q92576 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PHF3Q92576 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PHF3Q92576 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PHF3Q92576 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PHF3Q92576 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PHF3Q92576 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PHF3Q92576 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PHF3Q92576 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PHF3Q92576 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PHF3Q92576 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PHF3Q92576 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms