Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV44

TRIM41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM41Q8WV44 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
TRIM41Q8WV44 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
TRIM41Q8WV44 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
TRIM41Q8WV44 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
TRIM41Q8WV44 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC37.17■■■■□ 3.54
TRIM41Q8WV44 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
TRIM41Q8WV44 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.17■■■■□ 3.54
TRIM41Q8WV44 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC37.17■■■■□ 3.54
TRIM41Q8WV44 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.17■■■■□ 3.54
TRIM41Q8WV44 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
TRIM41Q8WV44 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC37.17■■■■□ 3.54
TRIM41Q8WV44 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
TRIM41Q8WV44 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
TRIM41Q8WV44 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.16■■■■□ 3.54
TRIM41Q8WV44 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC37.16■■■■□ 3.54
TRIM41Q8WV44 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
TRIM41Q8WV44 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC37.16■■■■□ 3.54
TRIM41Q8WV44 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC37.16■■■■□ 3.54
TRIM41Q8WV44 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
TRIM41Q8WV44 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC37.16■■■■□ 3.54
TRIM41Q8WV44 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
TRIM41Q8WV44 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC37.16■■■■□ 3.54
TRIM41Q8WV44 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC37.16■■■■□ 3.54
TRIM41Q8WV44 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
TRIM41Q8WV44 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
TRIM41Q8WV44 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
TRIM41Q8WV44 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC37.15■■■■□ 3.54
TRIM41Q8WV44 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
TRIM41Q8WV44 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC37.15■■■■□ 3.54
TRIM41Q8WV44 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
TRIM41Q8WV44 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
TRIM41Q8WV44 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC37.15■■■■□ 3.54
TRIM41Q8WV44 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
TRIM41Q8WV44 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC37.14■■■■□ 3.54
TRIM41Q8WV44 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC37.14■■■■□ 3.54
TRIM41Q8WV44 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC37.14■■■■□ 3.54
TRIM41Q8WV44 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC37.14■■■■□ 3.54
TRIM41Q8WV44 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
TRIM41Q8WV44 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC37.13■■■■□ 3.53
TRIM41Q8WV44 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC37.13■■■■□ 3.53
TRIM41Q8WV44 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
TRIM41Q8WV44 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC37.13■■■■□ 3.53
TRIM41Q8WV44 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
TRIM41Q8WV44 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
TRIM41Q8WV44 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
TRIM41Q8WV44 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
TRIM41Q8WV44 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
TRIM41Q8WV44 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
TRIM41Q8WV44 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
TRIM41Q8WV44 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
TRIM41Q8WV44 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.12■■■■□ 3.53
TRIM41Q8WV44 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
TRIM41Q8WV44 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC37.12■■■■□ 3.53
TRIM41Q8WV44 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC37.11■■■■□ 3.53
TRIM41Q8WV44 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
TRIM41Q8WV44 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC37.1■■■■□ 3.53
TRIM41Q8WV44 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.1■■■■□ 3.53
TRIM41Q8WV44 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.1■■■■□ 3.53
TRIM41Q8WV44 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
TRIM41Q8WV44 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
TRIM41Q8WV44 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC37.1■■■■□ 3.53
TRIM41Q8WV44 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC37.1■■■■□ 3.53
TRIM41Q8WV44 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
TRIM41Q8WV44 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC37.1■■■■□ 3.53
TRIM41Q8WV44 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC37.1■■■■□ 3.53
TRIM41Q8WV44 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
TRIM41Q8WV44 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
TRIM41Q8WV44 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC37.09■■■■□ 3.53
TRIM41Q8WV44 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC37.09■■■■□ 3.53
TRIM41Q8WV44 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC37.09■■■■□ 3.53
TRIM41Q8WV44 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC37.09■■■■□ 3.53
TRIM41Q8WV44 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
TRIM41Q8WV44 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
TRIM41Q8WV44 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
TRIM41Q8WV44 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
TRIM41Q8WV44 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.09■■■■□ 3.53
TRIM41Q8WV44 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC37.09■■■■□ 3.53
TRIM41Q8WV44 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC37.09■■■■□ 3.53
TRIM41Q8WV44 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.08■■■■□ 3.53
TRIM41Q8WV44 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
TRIM41Q8WV44 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC37.08■■■■□ 3.53
TRIM41Q8WV44 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
TRIM41Q8WV44 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC37.08■■■■□ 3.53
TRIM41Q8WV44 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
TRIM41Q8WV44 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC37.07■■■■□ 3.53
TRIM41Q8WV44 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC37.07■■■■□ 3.52
TRIM41Q8WV44 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
TRIM41Q8WV44 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC37.07■■■■□ 3.52
TRIM41Q8WV44 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC37.07■■■■□ 3.52
TRIM41Q8WV44 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
TRIM41Q8WV44 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.07■■■■□ 3.52
TRIM41Q8WV44 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC37.07■■■■□ 3.52
TRIM41Q8WV44 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC37.07■■■■□ 3.52
TRIM41Q8WV44 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.07■■■■□ 3.52
TRIM41Q8WV44 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC37.07■■■■□ 3.52
TRIM41Q8WV44 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC37.07■■■■□ 3.52
TRIM41Q8WV44 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
TRIM41Q8WV44 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC37.06■■■■□ 3.52
TRIM41Q8WV44 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC37.06■■■■□ 3.52
TRIM41Q8WV44 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC37.06■■■■□ 3.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms