Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV22

NSMCE1, Non-structural maintenance of chromosomes element 1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE1Q8WV22 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NSMCE1Q8WV22 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NSMCE1Q8WV22 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NSMCE1Q8WV22 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NSMCE1Q8WV22 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NSMCE1Q8WV22 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NSMCE1Q8WV22 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NSMCE1Q8WV22 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NSMCE1Q8WV22 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NSMCE1Q8WV22 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NSMCE1Q8WV22 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NSMCE1Q8WV22 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NSMCE1Q8WV22 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NSMCE1Q8WV22 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NSMCE1Q8WV22 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NSMCE1Q8WV22 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NSMCE1Q8WV22 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NSMCE1Q8WV22 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NSMCE1Q8WV22 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NSMCE1Q8WV22 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NSMCE1Q8WV22 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NSMCE1Q8WV22 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NSMCE1Q8WV22 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NSMCE1Q8WV22 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NSMCE1Q8WV22 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NSMCE1Q8WV22 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NSMCE1Q8WV22 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NSMCE1Q8WV22 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
NSMCE1Q8WV22 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NSMCE1Q8WV22 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
NSMCE1Q8WV22 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NSMCE1Q8WV22 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NSMCE1Q8WV22 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NSMCE1Q8WV22 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NSMCE1Q8WV22 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NSMCE1Q8WV22 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NSMCE1Q8WV22 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NSMCE1Q8WV22 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NSMCE1Q8WV22 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NSMCE1Q8WV22 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NSMCE1Q8WV22 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NSMCE1Q8WV22 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NSMCE1Q8WV22 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NSMCE1Q8WV22 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NSMCE1Q8WV22 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NSMCE1Q8WV22 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NSMCE1Q8WV22 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NSMCE1Q8WV22 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NSMCE1Q8WV22 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NSMCE1Q8WV22 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NSMCE1Q8WV22 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NSMCE1Q8WV22 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NSMCE1Q8WV22 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NSMCE1Q8WV22 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NSMCE1Q8WV22 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NSMCE1Q8WV22 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NSMCE1Q8WV22 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NSMCE1Q8WV22 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NSMCE1Q8WV22 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NSMCE1Q8WV22 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NSMCE1Q8WV22 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NSMCE1Q8WV22 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NSMCE1Q8WV22 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NSMCE1Q8WV22 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NSMCE1Q8WV22 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NSMCE1Q8WV22 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NSMCE1Q8WV22 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NSMCE1Q8WV22 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NSMCE1Q8WV22 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NSMCE1Q8WV22 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NSMCE1Q8WV22 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NSMCE1Q8WV22 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NSMCE1Q8WV22 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NSMCE1Q8WV22 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NSMCE1Q8WV22 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NSMCE1Q8WV22 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NSMCE1Q8WV22 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NSMCE1Q8WV22 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NSMCE1Q8WV22 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NSMCE1Q8WV22 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NSMCE1Q8WV22 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NSMCE1Q8WV22 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NSMCE1Q8WV22 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NSMCE1Q8WV22 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NSMCE1Q8WV22 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NSMCE1Q8WV22 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NSMCE1Q8WV22 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NSMCE1Q8WV22 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NSMCE1Q8WV22 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NSMCE1Q8WV22 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NSMCE1Q8WV22 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NSMCE1Q8WV22 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NSMCE1Q8WV22 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NSMCE1Q8WV22 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NSMCE1Q8WV22 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NSMCE1Q8WV22 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NSMCE1Q8WV22 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NSMCE1Q8WV22 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NSMCE1Q8WV22 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NSMCE1Q8WV22 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms