Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEQ0

SNX29, Sorting nexin-29, humanhuman

Predictions only

Length 813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29Q8TEQ0 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNX29Q8TEQ0 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNX29Q8TEQ0 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNX29Q8TEQ0 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNX29Q8TEQ0 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNX29Q8TEQ0 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNX29Q8TEQ0 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNX29Q8TEQ0 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNX29Q8TEQ0 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNX29Q8TEQ0 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNX29Q8TEQ0 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNX29Q8TEQ0 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNX29Q8TEQ0 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNX29Q8TEQ0 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNX29Q8TEQ0 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNX29Q8TEQ0 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNX29Q8TEQ0 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNX29Q8TEQ0 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNX29Q8TEQ0 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNX29Q8TEQ0 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNX29Q8TEQ0 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SNX29Q8TEQ0 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNX29Q8TEQ0 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNX29Q8TEQ0 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNX29Q8TEQ0 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNX29Q8TEQ0 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNX29Q8TEQ0 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNX29Q8TEQ0 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNX29Q8TEQ0 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNX29Q8TEQ0 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNX29Q8TEQ0 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNX29Q8TEQ0 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNX29Q8TEQ0 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNX29Q8TEQ0 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNX29Q8TEQ0 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNX29Q8TEQ0 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNX29Q8TEQ0 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNX29Q8TEQ0 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNX29Q8TEQ0 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNX29Q8TEQ0 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNX29Q8TEQ0 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNX29Q8TEQ0 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SNX29Q8TEQ0 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SNX29Q8TEQ0 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SNX29Q8TEQ0 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SNX29Q8TEQ0 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SNX29Q8TEQ0 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SNX29Q8TEQ0 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SNX29Q8TEQ0 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SNX29Q8TEQ0 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SNX29Q8TEQ0 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SNX29Q8TEQ0 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SNX29Q8TEQ0 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SNX29Q8TEQ0 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SNX29Q8TEQ0 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SNX29Q8TEQ0 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SNX29Q8TEQ0 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SNX29Q8TEQ0 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SNX29Q8TEQ0 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SNX29Q8TEQ0 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNX29Q8TEQ0 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNX29Q8TEQ0 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNX29Q8TEQ0 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNX29Q8TEQ0 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SNX29Q8TEQ0 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNX29Q8TEQ0 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNX29Q8TEQ0 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNX29Q8TEQ0 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNX29Q8TEQ0 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNX29Q8TEQ0 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNX29Q8TEQ0 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNX29Q8TEQ0 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNX29Q8TEQ0 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNX29Q8TEQ0 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNX29Q8TEQ0 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNX29Q8TEQ0 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNX29Q8TEQ0 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SNX29Q8TEQ0 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNX29Q8TEQ0 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNX29Q8TEQ0 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNX29Q8TEQ0 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNX29Q8TEQ0 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNX29Q8TEQ0 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNX29Q8TEQ0 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNX29Q8TEQ0 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNX29Q8TEQ0 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNX29Q8TEQ0 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNX29Q8TEQ0 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNX29Q8TEQ0 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNX29Q8TEQ0 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNX29Q8TEQ0 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNX29Q8TEQ0 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNX29Q8TEQ0 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNX29Q8TEQ0 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNX29Q8TEQ0 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNX29Q8TEQ0 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNX29Q8TEQ0 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNX29Q8TEQ0 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNX29Q8TEQ0 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNX29Q8TEQ0 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.5 ms