Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDG4

HELQ, Helicase POLQ-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELQQ8TDG4 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HELQQ8TDG4 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HELQQ8TDG4 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HELQQ8TDG4 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HELQQ8TDG4 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HELQQ8TDG4 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HELQQ8TDG4 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HELQQ8TDG4 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HELQQ8TDG4 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HELQQ8TDG4 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HELQQ8TDG4 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HELQQ8TDG4 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HELQQ8TDG4 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HELQQ8TDG4 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HELQQ8TDG4 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HELQQ8TDG4 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HELQQ8TDG4 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HELQQ8TDG4 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HELQQ8TDG4 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HELQQ8TDG4 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HELQQ8TDG4 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HELQQ8TDG4 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HELQQ8TDG4 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HELQQ8TDG4 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HELQQ8TDG4 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HELQQ8TDG4 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HELQQ8TDG4 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HELQQ8TDG4 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HELQQ8TDG4 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HELQQ8TDG4 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HELQQ8TDG4 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HELQQ8TDG4 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HELQQ8TDG4 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HELQQ8TDG4 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HELQQ8TDG4 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
HELQQ8TDG4 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HELQQ8TDG4 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HELQQ8TDG4 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HELQQ8TDG4 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HELQQ8TDG4 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HELQQ8TDG4 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
HELQQ8TDG4 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HELQQ8TDG4 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
HELQQ8TDG4 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HELQQ8TDG4 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HELQQ8TDG4 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HELQQ8TDG4 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HELQQ8TDG4 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HELQQ8TDG4 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HELQQ8TDG4 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HELQQ8TDG4 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HELQQ8TDG4 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HELQQ8TDG4 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HELQQ8TDG4 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HELQQ8TDG4 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HELQQ8TDG4 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HELQQ8TDG4 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
HELQQ8TDG4 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HELQQ8TDG4 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HELQQ8TDG4 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HELQQ8TDG4 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HELQQ8TDG4 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HELQQ8TDG4 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HELQQ8TDG4 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
HELQQ8TDG4 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HELQQ8TDG4 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HELQQ8TDG4 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
HELQQ8TDG4 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HELQQ8TDG4 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HELQQ8TDG4 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HELQQ8TDG4 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
HELQQ8TDG4 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HELQQ8TDG4 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HELQQ8TDG4 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HELQQ8TDG4 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HELQQ8TDG4 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HELQQ8TDG4 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HELQQ8TDG4 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HELQQ8TDG4 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HELQQ8TDG4 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HELQQ8TDG4 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HELQQ8TDG4 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HELQQ8TDG4 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HELQQ8TDG4 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HELQQ8TDG4 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HELQQ8TDG4 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HELQQ8TDG4 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HELQQ8TDG4 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HELQQ8TDG4 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HELQQ8TDG4 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HELQQ8TDG4 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HELQQ8TDG4 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HELQQ8TDG4 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HELQQ8TDG4 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HELQQ8TDG4 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HELQQ8TDG4 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HELQQ8TDG4 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HELQQ8TDG4 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HELQQ8TDG4 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HELQQ8TDG4 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms