Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAT6

NPLOC4, Nuclear protein localization protein 4 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPLOC4Q8TAT6 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
NPLOC4Q8TAT6 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
NPLOC4Q8TAT6 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NPLOC4Q8TAT6 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NPLOC4Q8TAT6 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NPLOC4Q8TAT6 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NPLOC4Q8TAT6 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NPLOC4Q8TAT6 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NPLOC4Q8TAT6 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NPLOC4Q8TAT6 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NPLOC4Q8TAT6 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NPLOC4Q8TAT6 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NPLOC4Q8TAT6 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NPLOC4Q8TAT6 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NPLOC4Q8TAT6 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NPLOC4Q8TAT6 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NPLOC4Q8TAT6 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NPLOC4Q8TAT6 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NPLOC4Q8TAT6 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NPLOC4Q8TAT6 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NPLOC4Q8TAT6 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NPLOC4Q8TAT6 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
NPLOC4Q8TAT6 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NPLOC4Q8TAT6 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NPLOC4Q8TAT6 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NPLOC4Q8TAT6 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NPLOC4Q8TAT6 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
NPLOC4Q8TAT6 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NPLOC4Q8TAT6 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NPLOC4Q8TAT6 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NPLOC4Q8TAT6 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NPLOC4Q8TAT6 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NPLOC4Q8TAT6 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NPLOC4Q8TAT6 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NPLOC4Q8TAT6 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NPLOC4Q8TAT6 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NPLOC4Q8TAT6 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NPLOC4Q8TAT6 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NPLOC4Q8TAT6 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NPLOC4Q8TAT6 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NPLOC4Q8TAT6 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NPLOC4Q8TAT6 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NPLOC4Q8TAT6 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NPLOC4Q8TAT6 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NPLOC4Q8TAT6 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NPLOC4Q8TAT6 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NPLOC4Q8TAT6 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NPLOC4Q8TAT6 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
NPLOC4Q8TAT6 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
NPLOC4Q8TAT6 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NPLOC4Q8TAT6 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NPLOC4Q8TAT6 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NPLOC4Q8TAT6 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NPLOC4Q8TAT6 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NPLOC4Q8TAT6 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NPLOC4Q8TAT6 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NPLOC4Q8TAT6 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
NPLOC4Q8TAT6 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NPLOC4Q8TAT6 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NPLOC4Q8TAT6 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NPLOC4Q8TAT6 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
NPLOC4Q8TAT6 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NPLOC4Q8TAT6 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NPLOC4Q8TAT6 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
NPLOC4Q8TAT6 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NPLOC4Q8TAT6 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NPLOC4Q8TAT6 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NPLOC4Q8TAT6 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NPLOC4Q8TAT6 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NPLOC4Q8TAT6 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NPLOC4Q8TAT6 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
NPLOC4Q8TAT6 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NPLOC4Q8TAT6 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
NPLOC4Q8TAT6 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NPLOC4Q8TAT6 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NPLOC4Q8TAT6 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NPLOC4Q8TAT6 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NPLOC4Q8TAT6 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NPLOC4Q8TAT6 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NPLOC4Q8TAT6 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NPLOC4Q8TAT6 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NPLOC4Q8TAT6 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NPLOC4Q8TAT6 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NPLOC4Q8TAT6 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NPLOC4Q8TAT6 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NPLOC4Q8TAT6 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NPLOC4Q8TAT6 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NPLOC4Q8TAT6 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NPLOC4Q8TAT6 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
NPLOC4Q8TAT6 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NPLOC4Q8TAT6 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NPLOC4Q8TAT6 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NPLOC4Q8TAT6 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NPLOC4Q8TAT6 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NPLOC4Q8TAT6 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NPLOC4Q8TAT6 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NPLOC4Q8TAT6 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NPLOC4Q8TAT6 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NPLOC4Q8TAT6 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NPLOC4Q8TAT6 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms