Protein–RNA interactions for Protein: Q8NI35

PATJ, InaD-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATJQ8NI35 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PATJQ8NI35 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PATJQ8NI35 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PATJQ8NI35 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PATJQ8NI35 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PATJQ8NI35 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PATJQ8NI35 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PATJQ8NI35 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PATJQ8NI35 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PATJQ8NI35 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PATJQ8NI35 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PATJQ8NI35 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PATJQ8NI35 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PATJQ8NI35 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PATJQ8NI35 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PATJQ8NI35 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PATJQ8NI35 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PATJQ8NI35 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PATJQ8NI35 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PATJQ8NI35 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PATJQ8NI35 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PATJQ8NI35 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PATJQ8NI35 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PATJQ8NI35 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PATJQ8NI35 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PATJQ8NI35 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PATJQ8NI35 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PATJQ8NI35 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PATJQ8NI35 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PATJQ8NI35 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PATJQ8NI35 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PATJQ8NI35 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PATJQ8NI35 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PATJQ8NI35 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PATJQ8NI35 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PATJQ8NI35 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PATJQ8NI35 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PATJQ8NI35 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PATJQ8NI35 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PATJQ8NI35 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PATJQ8NI35 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PATJQ8NI35 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PATJQ8NI35 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PATJQ8NI35 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PATJQ8NI35 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
PATJQ8NI35 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PATJQ8NI35 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PATJQ8NI35 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PATJQ8NI35 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PATJQ8NI35 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PATJQ8NI35 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PATJQ8NI35 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PATJQ8NI35 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PATJQ8NI35 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PATJQ8NI35 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PATJQ8NI35 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PATJQ8NI35 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PATJQ8NI35 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PATJQ8NI35 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PATJQ8NI35 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PATJQ8NI35 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PATJQ8NI35 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PATJQ8NI35 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PATJQ8NI35 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PATJQ8NI35 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PATJQ8NI35 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PATJQ8NI35 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PATJQ8NI35 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PATJQ8NI35 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PATJQ8NI35 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PATJQ8NI35 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PATJQ8NI35 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PATJQ8NI35 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PATJQ8NI35 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PATJQ8NI35 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PATJQ8NI35 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PATJQ8NI35 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PATJQ8NI35 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PATJQ8NI35 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PATJQ8NI35 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PATJQ8NI35 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PATJQ8NI35 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PATJQ8NI35 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PATJQ8NI35 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PATJQ8NI35 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PATJQ8NI35 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PATJQ8NI35 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PATJQ8NI35 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PATJQ8NI35 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PATJQ8NI35 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PATJQ8NI35 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PATJQ8NI35 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PATJQ8NI35 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PATJQ8NI35 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PATJQ8NI35 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PATJQ8NI35 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PATJQ8NI35 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PATJQ8NI35 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PATJQ8NI35 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PATJQ8NI35 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms