Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFJ5

GPRC5A, Retinoic acid-induced protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPRC5AQ8NFJ5 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GPRC5AQ8NFJ5 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GPRC5AQ8NFJ5 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GPRC5AQ8NFJ5 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GPRC5AQ8NFJ5 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GPRC5AQ8NFJ5 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GPRC5AQ8NFJ5 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GPRC5AQ8NFJ5 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GPRC5AQ8NFJ5 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GPRC5AQ8NFJ5 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GPRC5AQ8NFJ5 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GPRC5AQ8NFJ5 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GPRC5AQ8NFJ5 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GPRC5AQ8NFJ5 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GPRC5AQ8NFJ5 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
GPRC5AQ8NFJ5 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GPRC5AQ8NFJ5 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GPRC5AQ8NFJ5 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GPRC5AQ8NFJ5 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GPRC5AQ8NFJ5 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GPRC5AQ8NFJ5 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GPRC5AQ8NFJ5 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
GPRC5AQ8NFJ5 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GPRC5AQ8NFJ5 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GPRC5AQ8NFJ5 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GPRC5AQ8NFJ5 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GPRC5AQ8NFJ5 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GPRC5AQ8NFJ5 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
GPRC5AQ8NFJ5 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GPRC5AQ8NFJ5 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GPRC5AQ8NFJ5 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GPRC5AQ8NFJ5 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GPRC5AQ8NFJ5 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GPRC5AQ8NFJ5 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GPRC5AQ8NFJ5 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GPRC5AQ8NFJ5 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
GPRC5AQ8NFJ5 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
GPRC5AQ8NFJ5 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GPRC5AQ8NFJ5 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GPRC5AQ8NFJ5 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GPRC5AQ8NFJ5 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GPRC5AQ8NFJ5 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GPRC5AQ8NFJ5 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GPRC5AQ8NFJ5 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GPRC5AQ8NFJ5 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
GPRC5AQ8NFJ5 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
GPRC5AQ8NFJ5 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GPRC5AQ8NFJ5 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
GPRC5AQ8NFJ5 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GPRC5AQ8NFJ5 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GPRC5AQ8NFJ5 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GPRC5AQ8NFJ5 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
GPRC5AQ8NFJ5 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
GPRC5AQ8NFJ5 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GPRC5AQ8NFJ5 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GPRC5AQ8NFJ5 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GPRC5AQ8NFJ5 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GPRC5AQ8NFJ5 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GPRC5AQ8NFJ5 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GPRC5AQ8NFJ5 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GPRC5AQ8NFJ5 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GPRC5AQ8NFJ5 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GPRC5AQ8NFJ5 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GPRC5AQ8NFJ5 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
GPRC5AQ8NFJ5 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
GPRC5AQ8NFJ5 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
GPRC5AQ8NFJ5 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GPRC5AQ8NFJ5 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GPRC5AQ8NFJ5 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GPRC5AQ8NFJ5 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GPRC5AQ8NFJ5 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GPRC5AQ8NFJ5 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GPRC5AQ8NFJ5 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GPRC5AQ8NFJ5 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GPRC5AQ8NFJ5 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GPRC5AQ8NFJ5 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GPRC5AQ8NFJ5 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GPRC5AQ8NFJ5 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GPRC5AQ8NFJ5 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GPRC5AQ8NFJ5 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GPRC5AQ8NFJ5 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GPRC5AQ8NFJ5 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GPRC5AQ8NFJ5 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GPRC5AQ8NFJ5 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GPRC5AQ8NFJ5 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GPRC5AQ8NFJ5 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GPRC5AQ8NFJ5 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
GPRC5AQ8NFJ5 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GPRC5AQ8NFJ5 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GPRC5AQ8NFJ5 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GPRC5AQ8NFJ5 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GPRC5AQ8NFJ5 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GPRC5AQ8NFJ5 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GPRC5AQ8NFJ5 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GPRC5AQ8NFJ5 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
GPRC5AQ8NFJ5 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GPRC5AQ8NFJ5 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GPRC5AQ8NFJ5 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GPRC5AQ8NFJ5 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GPRC5AQ8NFJ5 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms