Protein–RNA interactions for Protein: Q8NF99

ZNF397, Zinc finger protein 397, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF397Q8NF99 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZNF397Q8NF99 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZNF397Q8NF99 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZNF397Q8NF99 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZNF397Q8NF99 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZNF397Q8NF99 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZNF397Q8NF99 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZNF397Q8NF99 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZNF397Q8NF99 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZNF397Q8NF99 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZNF397Q8NF99 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZNF397Q8NF99 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZNF397Q8NF99 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZNF397Q8NF99 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZNF397Q8NF99 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZNF397Q8NF99 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
ZNF397Q8NF99 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
ZNF397Q8NF99 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
ZNF397Q8NF99 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
ZNF397Q8NF99 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
ZNF397Q8NF99 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZNF397Q8NF99 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZNF397Q8NF99 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZNF397Q8NF99 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZNF397Q8NF99 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZNF397Q8NF99 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZNF397Q8NF99 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZNF397Q8NF99 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZNF397Q8NF99 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZNF397Q8NF99 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZNF397Q8NF99 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZNF397Q8NF99 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZNF397Q8NF99 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZNF397Q8NF99 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZNF397Q8NF99 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZNF397Q8NF99 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZNF397Q8NF99 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZNF397Q8NF99 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZNF397Q8NF99 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZNF397Q8NF99 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZNF397Q8NF99 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZNF397Q8NF99 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZNF397Q8NF99 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZNF397Q8NF99 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZNF397Q8NF99 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZNF397Q8NF99 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZNF397Q8NF99 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZNF397Q8NF99 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZNF397Q8NF99 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZNF397Q8NF99 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZNF397Q8NF99 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZNF397Q8NF99 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZNF397Q8NF99 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZNF397Q8NF99 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZNF397Q8NF99 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZNF397Q8NF99 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZNF397Q8NF99 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZNF397Q8NF99 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZNF397Q8NF99 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZNF397Q8NF99 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZNF397Q8NF99 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZNF397Q8NF99 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
ZNF397Q8NF99 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZNF397Q8NF99 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZNF397Q8NF99 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZNF397Q8NF99 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZNF397Q8NF99 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZNF397Q8NF99 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZNF397Q8NF99 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZNF397Q8NF99 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZNF397Q8NF99 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZNF397Q8NF99 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZNF397Q8NF99 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZNF397Q8NF99 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZNF397Q8NF99 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZNF397Q8NF99 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZNF397Q8NF99 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZNF397Q8NF99 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZNF397Q8NF99 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZNF397Q8NF99 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZNF397Q8NF99 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZNF397Q8NF99 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZNF397Q8NF99 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZNF397Q8NF99 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZNF397Q8NF99 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZNF397Q8NF99 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNF397Q8NF99 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNF397Q8NF99 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNF397Q8NF99 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNF397Q8NF99 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNF397Q8NF99 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNF397Q8NF99 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNF397Q8NF99 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNF397Q8NF99 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNF397Q8NF99 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNF397Q8NF99 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNF397Q8NF99 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNF397Q8NF99 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNF397Q8NF99 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNF397Q8NF99 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms