Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEF3

CCDC112, Coiled-coil domain-containing protein 112, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC112Q8NEF3 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC112Q8NEF3 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC112Q8NEF3 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC112Q8NEF3 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC112Q8NEF3 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC112Q8NEF3 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC112Q8NEF3 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC112Q8NEF3 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC112Q8NEF3 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC112Q8NEF3 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC112Q8NEF3 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC112Q8NEF3 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC112Q8NEF3 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC112Q8NEF3 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC112Q8NEF3 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC112Q8NEF3 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CCDC112Q8NEF3 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CCDC112Q8NEF3 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CCDC112Q8NEF3 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC112Q8NEF3 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC112Q8NEF3 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC112Q8NEF3 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC112Q8NEF3 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC112Q8NEF3 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC112Q8NEF3 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC112Q8NEF3 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC112Q8NEF3 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC112Q8NEF3 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC112Q8NEF3 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC112Q8NEF3 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC112Q8NEF3 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC112Q8NEF3 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC112Q8NEF3 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC112Q8NEF3 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC112Q8NEF3 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC112Q8NEF3 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC112Q8NEF3 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC112Q8NEF3 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC112Q8NEF3 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC112Q8NEF3 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC112Q8NEF3 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC112Q8NEF3 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC112Q8NEF3 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC112Q8NEF3 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC112Q8NEF3 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC112Q8NEF3 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC112Q8NEF3 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC112Q8NEF3 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC112Q8NEF3 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC112Q8NEF3 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC112Q8NEF3 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC112Q8NEF3 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC112Q8NEF3 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC112Q8NEF3 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC112Q8NEF3 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC112Q8NEF3 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC112Q8NEF3 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC112Q8NEF3 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC112Q8NEF3 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC112Q8NEF3 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC112Q8NEF3 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC112Q8NEF3 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC112Q8NEF3 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC112Q8NEF3 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC112Q8NEF3 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC112Q8NEF3 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC112Q8NEF3 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC112Q8NEF3 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC112Q8NEF3 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC112Q8NEF3 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC112Q8NEF3 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC112Q8NEF3 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC112Q8NEF3 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC112Q8NEF3 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC112Q8NEF3 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC112Q8NEF3 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC112Q8NEF3 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC112Q8NEF3 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC112Q8NEF3 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC112Q8NEF3 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC112Q8NEF3 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC112Q8NEF3 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC112Q8NEF3 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC112Q8NEF3 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC112Q8NEF3 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC112Q8NEF3 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC112Q8NEF3 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC112Q8NEF3 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC112Q8NEF3 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC112Q8NEF3 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC112Q8NEF3 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC112Q8NEF3 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC112Q8NEF3 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC112Q8NEF3 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC112Q8NEF3 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC112Q8NEF3 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC112Q8NEF3 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC112Q8NEF3 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC112Q8NEF3 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC112Q8NEF3 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms