Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCU4

CCDC191, Coiled-coil domain-containing protein 191, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC191Q8NCU4 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC191Q8NCU4 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC191Q8NCU4 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC191Q8NCU4 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC191Q8NCU4 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC191Q8NCU4 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC191Q8NCU4 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC191Q8NCU4 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC191Q8NCU4 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC191Q8NCU4 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC191Q8NCU4 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC191Q8NCU4 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC191Q8NCU4 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC191Q8NCU4 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC191Q8NCU4 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC191Q8NCU4 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CCDC191Q8NCU4 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CCDC191Q8NCU4 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CCDC191Q8NCU4 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
CCDC191Q8NCU4 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC191Q8NCU4 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC191Q8NCU4 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC191Q8NCU4 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC191Q8NCU4 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC191Q8NCU4 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC191Q8NCU4 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC191Q8NCU4 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC191Q8NCU4 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC191Q8NCU4 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC191Q8NCU4 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC191Q8NCU4 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC191Q8NCU4 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC191Q8NCU4 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC191Q8NCU4 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC191Q8NCU4 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC191Q8NCU4 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC191Q8NCU4 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC191Q8NCU4 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC191Q8NCU4 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC191Q8NCU4 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC191Q8NCU4 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC191Q8NCU4 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC191Q8NCU4 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC191Q8NCU4 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC191Q8NCU4 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC191Q8NCU4 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC191Q8NCU4 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC191Q8NCU4 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC191Q8NCU4 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC191Q8NCU4 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC191Q8NCU4 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC191Q8NCU4 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC191Q8NCU4 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC191Q8NCU4 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC191Q8NCU4 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC191Q8NCU4 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC191Q8NCU4 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC191Q8NCU4 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC191Q8NCU4 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC191Q8NCU4 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC191Q8NCU4 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC191Q8NCU4 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC191Q8NCU4 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC191Q8NCU4 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC191Q8NCU4 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC191Q8NCU4 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC191Q8NCU4 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC191Q8NCU4 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC191Q8NCU4 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC191Q8NCU4 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC191Q8NCU4 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC191Q8NCU4 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC191Q8NCU4 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC191Q8NCU4 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC191Q8NCU4 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC191Q8NCU4 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC191Q8NCU4 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC191Q8NCU4 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC191Q8NCU4 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC191Q8NCU4 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC191Q8NCU4 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC191Q8NCU4 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC191Q8NCU4 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC191Q8NCU4 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC191Q8NCU4 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC191Q8NCU4 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC191Q8NCU4 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC191Q8NCU4 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC191Q8NCU4 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.92
CCDC191Q8NCU4 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC191Q8NCU4 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC191Q8NCU4 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC191Q8NCU4 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC191Q8NCU4 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC191Q8NCU4 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC191Q8NCU4 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC191Q8NCU4 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC191Q8NCU4 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC191Q8NCU4 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC191Q8NCU4 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms