Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA66

CNBD1, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD1Q8NA66 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CNBD1Q8NA66 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CNBD1Q8NA66 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CNBD1Q8NA66 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CNBD1Q8NA66 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CNBD1Q8NA66 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CNBD1Q8NA66 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CNBD1Q8NA66 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CNBD1Q8NA66 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CNBD1Q8NA66 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CNBD1Q8NA66 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CNBD1Q8NA66 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CNBD1Q8NA66 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CNBD1Q8NA66 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CNBD1Q8NA66 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CNBD1Q8NA66 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CNBD1Q8NA66 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
CNBD1Q8NA66 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CNBD1Q8NA66 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CNBD1Q8NA66 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CNBD1Q8NA66 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CNBD1Q8NA66 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CNBD1Q8NA66 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CNBD1Q8NA66 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CNBD1Q8NA66 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CNBD1Q8NA66 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CNBD1Q8NA66 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CNBD1Q8NA66 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CNBD1Q8NA66 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CNBD1Q8NA66 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CNBD1Q8NA66 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
CNBD1Q8NA66 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
CNBD1Q8NA66 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
CNBD1Q8NA66 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
CNBD1Q8NA66 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CNBD1Q8NA66 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CNBD1Q8NA66 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CNBD1Q8NA66 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CNBD1Q8NA66 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CNBD1Q8NA66 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CNBD1Q8NA66 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CNBD1Q8NA66 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
CNBD1Q8NA66 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CNBD1Q8NA66 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CNBD1Q8NA66 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CNBD1Q8NA66 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CNBD1Q8NA66 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CNBD1Q8NA66 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CNBD1Q8NA66 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CNBD1Q8NA66 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CNBD1Q8NA66 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CNBD1Q8NA66 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
CNBD1Q8NA66 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CNBD1Q8NA66 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CNBD1Q8NA66 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CNBD1Q8NA66 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CNBD1Q8NA66 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CNBD1Q8NA66 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CNBD1Q8NA66 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CNBD1Q8NA66 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CNBD1Q8NA66 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CNBD1Q8NA66 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CNBD1Q8NA66 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CNBD1Q8NA66 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CNBD1Q8NA66 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CNBD1Q8NA66 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CNBD1Q8NA66 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
CNBD1Q8NA66 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CNBD1Q8NA66 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CNBD1Q8NA66 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CNBD1Q8NA66 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
CNBD1Q8NA66 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CNBD1Q8NA66 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CNBD1Q8NA66 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CNBD1Q8NA66 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CNBD1Q8NA66 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CNBD1Q8NA66 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CNBD1Q8NA66 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CNBD1Q8NA66 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CNBD1Q8NA66 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CNBD1Q8NA66 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
CNBD1Q8NA66 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CNBD1Q8NA66 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CNBD1Q8NA66 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CNBD1Q8NA66 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CNBD1Q8NA66 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CNBD1Q8NA66 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CNBD1Q8NA66 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CNBD1Q8NA66 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CNBD1Q8NA66 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
CNBD1Q8NA66 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
CNBD1Q8NA66 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CNBD1Q8NA66 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CNBD1Q8NA66 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CNBD1Q8NA66 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CNBD1Q8NA66 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CNBD1Q8NA66 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CNBD1Q8NA66 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CNBD1Q8NA66 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CNBD1Q8NA66 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms