Protein–RNA interactions for Protein: Q8N715

CCDC185, Coiled-coil domain-containing protein 185, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC185Q8N715 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC185Q8N715 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC185Q8N715 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC185Q8N715 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC185Q8N715 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC185Q8N715 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC185Q8N715 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC185Q8N715 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC185Q8N715 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC185Q8N715 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC185Q8N715 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC185Q8N715 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC185Q8N715 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC185Q8N715 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC185Q8N715 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC185Q8N715 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC185Q8N715 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC185Q8N715 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC185Q8N715 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC185Q8N715 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC185Q8N715 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC185Q8N715 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC185Q8N715 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC185Q8N715 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC185Q8N715 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC185Q8N715 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC185Q8N715 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC185Q8N715 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC185Q8N715 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC185Q8N715 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CCDC185Q8N715 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CCDC185Q8N715 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC185Q8N715 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC185Q8N715 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC185Q8N715 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC185Q8N715 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC185Q8N715 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC185Q8N715 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC185Q8N715 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC185Q8N715 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC185Q8N715 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC185Q8N715 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC185Q8N715 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC185Q8N715 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC185Q8N715 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC185Q8N715 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC185Q8N715 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC185Q8N715 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC185Q8N715 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC185Q8N715 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC185Q8N715 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC185Q8N715 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC185Q8N715 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC185Q8N715 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC185Q8N715 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC185Q8N715 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC185Q8N715 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC185Q8N715 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC185Q8N715 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC185Q8N715 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC185Q8N715 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC185Q8N715 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC185Q8N715 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC185Q8N715 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC185Q8N715 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC185Q8N715 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC185Q8N715 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC185Q8N715 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC185Q8N715 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC185Q8N715 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC185Q8N715 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC185Q8N715 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC185Q8N715 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC185Q8N715 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC185Q8N715 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC185Q8N715 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC185Q8N715 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC185Q8N715 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC185Q8N715 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC185Q8N715 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC185Q8N715 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC185Q8N715 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC185Q8N715 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC185Q8N715 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC185Q8N715 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC185Q8N715 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC185Q8N715 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC185Q8N715 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC185Q8N715 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC185Q8N715 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC185Q8N715 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC185Q8N715 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC185Q8N715 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC185Q8N715 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC185Q8N715 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC185Q8N715 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC185Q8N715 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC185Q8N715 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC185Q8N715 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC185Q8N715 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms