Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Q1

CHCHD4, Mitochondrial intermembrane space import and assembly protein 40, humanhuman

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Length 142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD4Q8N4Q1 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHCHD4Q8N4Q1 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHCHD4Q8N4Q1 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CHCHD4Q8N4Q1 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHCHD4Q8N4Q1 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHCHD4Q8N4Q1 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHCHD4Q8N4Q1 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHCHD4Q8N4Q1 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHCHD4Q8N4Q1 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHCHD4Q8N4Q1 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHCHD4Q8N4Q1 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHCHD4Q8N4Q1 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHCHD4Q8N4Q1 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHCHD4Q8N4Q1 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHCHD4Q8N4Q1 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHCHD4Q8N4Q1 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHCHD4Q8N4Q1 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHCHD4Q8N4Q1 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHCHD4Q8N4Q1 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHCHD4Q8N4Q1 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHCHD4Q8N4Q1 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHCHD4Q8N4Q1 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CHCHD4Q8N4Q1 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CHCHD4Q8N4Q1 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CHCHD4Q8N4Q1 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CHCHD4Q8N4Q1 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHCHD4Q8N4Q1 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHCHD4Q8N4Q1 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHCHD4Q8N4Q1 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHCHD4Q8N4Q1 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHCHD4Q8N4Q1 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHCHD4Q8N4Q1 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHCHD4Q8N4Q1 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHCHD4Q8N4Q1 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHCHD4Q8N4Q1 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHCHD4Q8N4Q1 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CHCHD4Q8N4Q1 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHCHD4Q8N4Q1 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHCHD4Q8N4Q1 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHCHD4Q8N4Q1 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHCHD4Q8N4Q1 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHCHD4Q8N4Q1 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHCHD4Q8N4Q1 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHCHD4Q8N4Q1 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CHCHD4Q8N4Q1 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHCHD4Q8N4Q1 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHCHD4Q8N4Q1 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHCHD4Q8N4Q1 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHCHD4Q8N4Q1 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHCHD4Q8N4Q1 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CHCHD4Q8N4Q1 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHCHD4Q8N4Q1 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHCHD4Q8N4Q1 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHCHD4Q8N4Q1 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHCHD4Q8N4Q1 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHCHD4Q8N4Q1 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CHCHD4Q8N4Q1 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHCHD4Q8N4Q1 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CHCHD4Q8N4Q1 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHCHD4Q8N4Q1 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHCHD4Q8N4Q1 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHCHD4Q8N4Q1 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHCHD4Q8N4Q1 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHCHD4Q8N4Q1 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHCHD4Q8N4Q1 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHCHD4Q8N4Q1 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHCHD4Q8N4Q1 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHCHD4Q8N4Q1 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHCHD4Q8N4Q1 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHCHD4Q8N4Q1 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHCHD4Q8N4Q1 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHCHD4Q8N4Q1 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHCHD4Q8N4Q1 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHCHD4Q8N4Q1 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHCHD4Q8N4Q1 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CHCHD4Q8N4Q1 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHCHD4Q8N4Q1 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CHCHD4Q8N4Q1 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHCHD4Q8N4Q1 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHCHD4Q8N4Q1 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHCHD4Q8N4Q1 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHCHD4Q8N4Q1 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHCHD4Q8N4Q1 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHCHD4Q8N4Q1 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHCHD4Q8N4Q1 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHCHD4Q8N4Q1 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHCHD4Q8N4Q1 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHCHD4Q8N4Q1 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHCHD4Q8N4Q1 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHCHD4Q8N4Q1 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHCHD4Q8N4Q1 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHCHD4Q8N4Q1 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHCHD4Q8N4Q1 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHCHD4Q8N4Q1 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHCHD4Q8N4Q1 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHCHD4Q8N4Q1 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHCHD4Q8N4Q1 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHCHD4Q8N4Q1 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHCHD4Q8N4Q1 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHCHD4Q8N4Q1 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
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