Protein–RNA interactions for Protein: Q8N271

PROM2, Prominin-2, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROM2Q8N271 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PROM2Q8N271 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PROM2Q8N271 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PROM2Q8N271 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PROM2Q8N271 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PROM2Q8N271 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PROM2Q8N271 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PROM2Q8N271 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PROM2Q8N271 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PROM2Q8N271 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PROM2Q8N271 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PROM2Q8N271 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PROM2Q8N271 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PROM2Q8N271 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
PROM2Q8N271 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PROM2Q8N271 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PROM2Q8N271 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PROM2Q8N271 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PROM2Q8N271 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PROM2Q8N271 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PROM2Q8N271 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PROM2Q8N271 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
PROM2Q8N271 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PROM2Q8N271 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PROM2Q8N271 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
PROM2Q8N271 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
PROM2Q8N271 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PROM2Q8N271 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PROM2Q8N271 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PROM2Q8N271 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PROM2Q8N271 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PROM2Q8N271 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PROM2Q8N271 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PROM2Q8N271 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PROM2Q8N271 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PROM2Q8N271 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PROM2Q8N271 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
PROM2Q8N271 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
PROM2Q8N271 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PROM2Q8N271 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PROM2Q8N271 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PROM2Q8N271 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
PROM2Q8N271 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PROM2Q8N271 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PROM2Q8N271 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
PROM2Q8N271 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PROM2Q8N271 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
PROM2Q8N271 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PROM2Q8N271 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PROM2Q8N271 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PROM2Q8N271 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PROM2Q8N271 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PROM2Q8N271 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PROM2Q8N271 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PROM2Q8N271 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
PROM2Q8N271 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PROM2Q8N271 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
PROM2Q8N271 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PROM2Q8N271 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PROM2Q8N271 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PROM2Q8N271 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PROM2Q8N271 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PROM2Q8N271 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PROM2Q8N271 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PROM2Q8N271 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PROM2Q8N271 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PROM2Q8N271 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PROM2Q8N271 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PROM2Q8N271 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PROM2Q8N271 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PROM2Q8N271 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PROM2Q8N271 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PROM2Q8N271 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PROM2Q8N271 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PROM2Q8N271 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PROM2Q8N271 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PROM2Q8N271 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PROM2Q8N271 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PROM2Q8N271 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PROM2Q8N271 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PROM2Q8N271 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
PROM2Q8N271 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PROM2Q8N271 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PROM2Q8N271 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PROM2Q8N271 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
PROM2Q8N271 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PROM2Q8N271 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PROM2Q8N271 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PROM2Q8N271 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PROM2Q8N271 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PROM2Q8N271 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PROM2Q8N271 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PROM2Q8N271 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PROM2Q8N271 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PROM2Q8N271 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
PROM2Q8N271 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PROM2Q8N271 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PROM2Q8N271 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PROM2Q8N271 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PROM2Q8N271 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms