Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z6B7

SRGAP1, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP1Q7Z6B7 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SRGAP1Q7Z6B7 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SRGAP1Q7Z6B7 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SRGAP1Q7Z6B7 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SRGAP1Q7Z6B7 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SRGAP1Q7Z6B7 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SRGAP1Q7Z6B7 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SRGAP1Q7Z6B7 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SRGAP1Q7Z6B7 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SRGAP1Q7Z6B7 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SRGAP1Q7Z6B7 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SRGAP1Q7Z6B7 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SRGAP1Q7Z6B7 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SRGAP1Q7Z6B7 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SRGAP1Q7Z6B7 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SRGAP1Q7Z6B7 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SRGAP1Q7Z6B7 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SRGAP1Q7Z6B7 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SRGAP1Q7Z6B7 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SRGAP1Q7Z6B7 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SRGAP1Q7Z6B7 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SRGAP1Q7Z6B7 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SRGAP1Q7Z6B7 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SRGAP1Q7Z6B7 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SRGAP1Q7Z6B7 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SRGAP1Q7Z6B7 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SRGAP1Q7Z6B7 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SRGAP1Q7Z6B7 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SRGAP1Q7Z6B7 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SRGAP1Q7Z6B7 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SRGAP1Q7Z6B7 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SRGAP1Q7Z6B7 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SRGAP1Q7Z6B7 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SRGAP1Q7Z6B7 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SRGAP1Q7Z6B7 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SRGAP1Q7Z6B7 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SRGAP1Q7Z6B7 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SRGAP1Q7Z6B7 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SRGAP1Q7Z6B7 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SRGAP1Q7Z6B7 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SRGAP1Q7Z6B7 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SRGAP1Q7Z6B7 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SRGAP1Q7Z6B7 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SRGAP1Q7Z6B7 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SRGAP1Q7Z6B7 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SRGAP1Q7Z6B7 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SRGAP1Q7Z6B7 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SRGAP1Q7Z6B7 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SRGAP1Q7Z6B7 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SRGAP1Q7Z6B7 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SRGAP1Q7Z6B7 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SRGAP1Q7Z6B7 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SRGAP1Q7Z6B7 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SRGAP1Q7Z6B7 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SRGAP1Q7Z6B7 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SRGAP1Q7Z6B7 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SRGAP1Q7Z6B7 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SRGAP1Q7Z6B7 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SRGAP1Q7Z6B7 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SRGAP1Q7Z6B7 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SRGAP1Q7Z6B7 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SRGAP1Q7Z6B7 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SRGAP1Q7Z6B7 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SRGAP1Q7Z6B7 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SRGAP1Q7Z6B7 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SRGAP1Q7Z6B7 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SRGAP1Q7Z6B7 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SRGAP1Q7Z6B7 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SRGAP1Q7Z6B7 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SRGAP1Q7Z6B7 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SRGAP1Q7Z6B7 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SRGAP1Q7Z6B7 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SRGAP1Q7Z6B7 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SRGAP1Q7Z6B7 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SRGAP1Q7Z6B7 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SRGAP1Q7Z6B7 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SRGAP1Q7Z6B7 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SRGAP1Q7Z6B7 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SRGAP1Q7Z6B7 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SRGAP1Q7Z6B7 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SRGAP1Q7Z6B7 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SRGAP1Q7Z6B7 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SRGAP1Q7Z6B7 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SRGAP1Q7Z6B7 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SRGAP1Q7Z6B7 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SRGAP1Q7Z6B7 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SRGAP1Q7Z6B7 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SRGAP1Q7Z6B7 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SRGAP1Q7Z6B7 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SRGAP1Q7Z6B7 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SRGAP1Q7Z6B7 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SRGAP1Q7Z6B7 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SRGAP1Q7Z6B7 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SRGAP1Q7Z6B7 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SRGAP1Q7Z6B7 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SRGAP1Q7Z6B7 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SRGAP1Q7Z6B7 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SRGAP1Q7Z6B7 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SRGAP1Q7Z6B7 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SRGAP1Q7Z6B7 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms