Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z569

BRAP, BRCA1-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRAPQ7Z569 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BRAPQ7Z569 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BRAPQ7Z569 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BRAPQ7Z569 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BRAPQ7Z569 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BRAPQ7Z569 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BRAPQ7Z569 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BRAPQ7Z569 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BRAPQ7Z569 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BRAPQ7Z569 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BRAPQ7Z569 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BRAPQ7Z569 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BRAPQ7Z569 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BRAPQ7Z569 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BRAPQ7Z569 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BRAPQ7Z569 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BRAPQ7Z569 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BRAPQ7Z569 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BRAPQ7Z569 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BRAPQ7Z569 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BRAPQ7Z569 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BRAPQ7Z569 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
BRAPQ7Z569 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BRAPQ7Z569 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BRAPQ7Z569 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BRAPQ7Z569 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BRAPQ7Z569 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BRAPQ7Z569 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
BRAPQ7Z569 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
BRAPQ7Z569 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
BRAPQ7Z569 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
BRAPQ7Z569 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BRAPQ7Z569 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BRAPQ7Z569 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BRAPQ7Z569 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BRAPQ7Z569 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BRAPQ7Z569 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
BRAPQ7Z569 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BRAPQ7Z569 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
BRAPQ7Z569 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
BRAPQ7Z569 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
BRAPQ7Z569 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
BRAPQ7Z569 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BRAPQ7Z569 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
BRAPQ7Z569 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
BRAPQ7Z569 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BRAPQ7Z569 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
BRAPQ7Z569 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BRAPQ7Z569 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BRAPQ7Z569 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
BRAPQ7Z569 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BRAPQ7Z569 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BRAPQ7Z569 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
BRAPQ7Z569 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
BRAPQ7Z569 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BRAPQ7Z569 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BRAPQ7Z569 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BRAPQ7Z569 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BRAPQ7Z569 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BRAPQ7Z569 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BRAPQ7Z569 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
BRAPQ7Z569 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BRAPQ7Z569 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BRAPQ7Z569 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
BRAPQ7Z569 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
BRAPQ7Z569 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
BRAPQ7Z569 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BRAPQ7Z569 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
BRAPQ7Z569 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BRAPQ7Z569 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
BRAPQ7Z569 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BRAPQ7Z569 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BRAPQ7Z569 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BRAPQ7Z569 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BRAPQ7Z569 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BRAPQ7Z569 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BRAPQ7Z569 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BRAPQ7Z569 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
BRAPQ7Z569 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BRAPQ7Z569 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BRAPQ7Z569 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BRAPQ7Z569 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BRAPQ7Z569 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BRAPQ7Z569 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BRAPQ7Z569 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BRAPQ7Z569 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
BRAPQ7Z569 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
BRAPQ7Z569 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
BRAPQ7Z569 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
BRAPQ7Z569 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BRAPQ7Z569 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BRAPQ7Z569 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BRAPQ7Z569 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
BRAPQ7Z569 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BRAPQ7Z569 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BRAPQ7Z569 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
BRAPQ7Z569 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BRAPQ7Z569 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BRAPQ7Z569 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BRAPQ7Z569 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms