Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Z2

RD3, Protein RD3, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RD3Q7Z3Z2 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RD3Q7Z3Z2 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RD3Q7Z3Z2 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RD3Q7Z3Z2 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RD3Q7Z3Z2 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RD3Q7Z3Z2 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RD3Q7Z3Z2 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
RD3Q7Z3Z2 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.3■■□□□ 1
RD3Q7Z3Z2 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.3■■□□□ 1
RD3Q7Z3Z2 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.3■■□□□ 1
RD3Q7Z3Z2 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.3■■□□□ 1
RD3Q7Z3Z2 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RD3Q7Z3Z2 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RD3Q7Z3Z2 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RD3Q7Z3Z2 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RD3Q7Z3Z2 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RD3Q7Z3Z2 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RD3Q7Z3Z2 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
RD3Q7Z3Z2 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RD3Q7Z3Z2 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RD3Q7Z3Z2 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RD3Q7Z3Z2 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RD3Q7Z3Z2 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RD3Q7Z3Z2 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RD3Q7Z3Z2 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RD3Q7Z3Z2 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RD3Q7Z3Z2 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RD3Q7Z3Z2 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RD3Q7Z3Z2 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RD3Q7Z3Z2 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RD3Q7Z3Z2 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RD3Q7Z3Z2 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RD3Q7Z3Z2 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RD3Q7Z3Z2 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RD3Q7Z3Z2 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RD3Q7Z3Z2 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RD3Q7Z3Z2 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RD3Q7Z3Z2 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RD3Q7Z3Z2 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RD3Q7Z3Z2 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RD3Q7Z3Z2 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RD3Q7Z3Z2 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RD3Q7Z3Z2 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RD3Q7Z3Z2 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RD3Q7Z3Z2 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RD3Q7Z3Z2 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
RD3Q7Z3Z2 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
RD3Q7Z3Z2 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
RD3Q7Z3Z2 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
RD3Q7Z3Z2 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RD3Q7Z3Z2 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RD3Q7Z3Z2 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RD3Q7Z3Z2 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
RD3Q7Z3Z2 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
RD3Q7Z3Z2 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RD3Q7Z3Z2 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RD3Q7Z3Z2 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
RD3Q7Z3Z2 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RD3Q7Z3Z2 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RD3Q7Z3Z2 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RD3Q7Z3Z2 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RD3Q7Z3Z2 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RD3Q7Z3Z2 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RD3Q7Z3Z2 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RD3Q7Z3Z2 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RD3Q7Z3Z2 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RD3Q7Z3Z2 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RD3Q7Z3Z2 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RD3Q7Z3Z2 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RD3Q7Z3Z2 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RD3Q7Z3Z2 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RD3Q7Z3Z2 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
RD3Q7Z3Z2 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RD3Q7Z3Z2 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RD3Q7Z3Z2 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RD3Q7Z3Z2 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RD3Q7Z3Z2 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RD3Q7Z3Z2 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RD3Q7Z3Z2 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RD3Q7Z3Z2 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RD3Q7Z3Z2 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RD3Q7Z3Z2 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RD3Q7Z3Z2 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RD3Q7Z3Z2 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RD3Q7Z3Z2 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RD3Q7Z3Z2 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RD3Q7Z3Z2 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RD3Q7Z3Z2 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RD3Q7Z3Z2 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RD3Q7Z3Z2 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RD3Q7Z3Z2 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RD3Q7Z3Z2 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RD3Q7Z3Z2 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RD3Q7Z3Z2 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RD3Q7Z3Z2 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RD3Q7Z3Z2 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RD3Q7Z3Z2 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RD3Q7Z3Z2 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RD3Q7Z3Z2 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RD3Q7Z3Z2 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms