Protein–RNA interactions for Protein: Q7LC44

ARC, Activity-regulated cytoskeleton-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARCQ7LC44 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARCQ7LC44 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARCQ7LC44 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ARCQ7LC44 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ARCQ7LC44 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARCQ7LC44 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARCQ7LC44 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARCQ7LC44 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARCQ7LC44 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARCQ7LC44 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARCQ7LC44 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARCQ7LC44 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARCQ7LC44 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARCQ7LC44 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARCQ7LC44 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARCQ7LC44 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARCQ7LC44 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARCQ7LC44 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARCQ7LC44 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARCQ7LC44 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARCQ7LC44 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARCQ7LC44 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARCQ7LC44 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARCQ7LC44 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARCQ7LC44 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARCQ7LC44 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ARCQ7LC44 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARCQ7LC44 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARCQ7LC44 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARCQ7LC44 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARCQ7LC44 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARCQ7LC44 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARCQ7LC44 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARCQ7LC44 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARCQ7LC44 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARCQ7LC44 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARCQ7LC44 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARCQ7LC44 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARCQ7LC44 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ARCQ7LC44 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARCQ7LC44 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARCQ7LC44 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ARCQ7LC44 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ARCQ7LC44 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ARCQ7LC44 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ARCQ7LC44 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ARCQ7LC44 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ARCQ7LC44 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARCQ7LC44 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARCQ7LC44 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARCQ7LC44 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARCQ7LC44 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARCQ7LC44 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARCQ7LC44 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARCQ7LC44 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARCQ7LC44 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARCQ7LC44 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARCQ7LC44 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARCQ7LC44 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARCQ7LC44 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARCQ7LC44 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARCQ7LC44 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARCQ7LC44 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARCQ7LC44 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARCQ7LC44 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARCQ7LC44 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARCQ7LC44 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARCQ7LC44 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARCQ7LC44 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARCQ7LC44 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARCQ7LC44 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARCQ7LC44 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARCQ7LC44 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARCQ7LC44 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARCQ7LC44 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARCQ7LC44 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARCQ7LC44 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARCQ7LC44 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARCQ7LC44 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARCQ7LC44 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARCQ7LC44 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARCQ7LC44 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARCQ7LC44 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARCQ7LC44 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARCQ7LC44 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARCQ7LC44 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARCQ7LC44 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARCQ7LC44 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARCQ7LC44 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARCQ7LC44 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARCQ7LC44 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARCQ7LC44 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARCQ7LC44 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARCQ7LC44 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARCQ7LC44 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARCQ7LC44 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARCQ7LC44 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARCQ7LC44 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARCQ7LC44 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARCQ7LC44 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms