Protein–RNA interactions for Protein: Q712K3

UBE2R2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 R2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2R2Q712K3 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
UBE2R2Q712K3 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
UBE2R2Q712K3 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
UBE2R2Q712K3 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
UBE2R2Q712K3 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
UBE2R2Q712K3 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
UBE2R2Q712K3 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
UBE2R2Q712K3 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
UBE2R2Q712K3 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
UBE2R2Q712K3 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
UBE2R2Q712K3 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
UBE2R2Q712K3 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
UBE2R2Q712K3 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
UBE2R2Q712K3 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
UBE2R2Q712K3 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
UBE2R2Q712K3 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
UBE2R2Q712K3 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
UBE2R2Q712K3 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
UBE2R2Q712K3 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
UBE2R2Q712K3 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
UBE2R2Q712K3 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
UBE2R2Q712K3 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
UBE2R2Q712K3 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
UBE2R2Q712K3 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
UBE2R2Q712K3 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
UBE2R2Q712K3 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
UBE2R2Q712K3 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
UBE2R2Q712K3 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
UBE2R2Q712K3 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
UBE2R2Q712K3 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
UBE2R2Q712K3 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
UBE2R2Q712K3 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
UBE2R2Q712K3 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
UBE2R2Q712K3 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
UBE2R2Q712K3 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
UBE2R2Q712K3 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
UBE2R2Q712K3 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
UBE2R2Q712K3 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
UBE2R2Q712K3 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
UBE2R2Q712K3 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
UBE2R2Q712K3 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
UBE2R2Q712K3 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
UBE2R2Q712K3 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
UBE2R2Q712K3 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
UBE2R2Q712K3 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
UBE2R2Q712K3 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
UBE2R2Q712K3 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
UBE2R2Q712K3 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
UBE2R2Q712K3 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
UBE2R2Q712K3 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
UBE2R2Q712K3 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
UBE2R2Q712K3 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
UBE2R2Q712K3 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
UBE2R2Q712K3 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
UBE2R2Q712K3 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
UBE2R2Q712K3 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
UBE2R2Q712K3 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
UBE2R2Q712K3 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
UBE2R2Q712K3 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
UBE2R2Q712K3 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
UBE2R2Q712K3 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
UBE2R2Q712K3 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
UBE2R2Q712K3 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
UBE2R2Q712K3 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
UBE2R2Q712K3 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
UBE2R2Q712K3 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
UBE2R2Q712K3 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
UBE2R2Q712K3 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
UBE2R2Q712K3 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
UBE2R2Q712K3 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
UBE2R2Q712K3 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
UBE2R2Q712K3 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
UBE2R2Q712K3 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
UBE2R2Q712K3 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
UBE2R2Q712K3 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
UBE2R2Q712K3 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
UBE2R2Q712K3 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
UBE2R2Q712K3 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
UBE2R2Q712K3 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
UBE2R2Q712K3 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
UBE2R2Q712K3 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
UBE2R2Q712K3 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
UBE2R2Q712K3 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
UBE2R2Q712K3 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
UBE2R2Q712K3 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
UBE2R2Q712K3 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
UBE2R2Q712K3 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
UBE2R2Q712K3 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
UBE2R2Q712K3 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
UBE2R2Q712K3 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
UBE2R2Q712K3 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
UBE2R2Q712K3 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
UBE2R2Q712K3 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
UBE2R2Q712K3 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
UBE2R2Q712K3 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
UBE2R2Q712K3 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
UBE2R2Q712K3 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
UBE2R2Q712K3 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
UBE2R2Q712K3 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
UBE2R2Q712K3 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms