Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZUS6

CCDC149, Coiled-coil domain-containing protein 149, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC149Q6ZUS6 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC149Q6ZUS6 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC149Q6ZUS6 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC149Q6ZUS6 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC149Q6ZUS6 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC149Q6ZUS6 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC149Q6ZUS6 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC149Q6ZUS6 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC149Q6ZUS6 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC149Q6ZUS6 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC149Q6ZUS6 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC149Q6ZUS6 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC149Q6ZUS6 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC149Q6ZUS6 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC149Q6ZUS6 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC149Q6ZUS6 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC149Q6ZUS6 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC149Q6ZUS6 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC149Q6ZUS6 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC149Q6ZUS6 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC149Q6ZUS6 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC149Q6ZUS6 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC149Q6ZUS6 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC149Q6ZUS6 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC149Q6ZUS6 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC149Q6ZUS6 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC149Q6ZUS6 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC149Q6ZUS6 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC149Q6ZUS6 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC149Q6ZUS6 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC149Q6ZUS6 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC149Q6ZUS6 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC149Q6ZUS6 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC149Q6ZUS6 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC149Q6ZUS6 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC149Q6ZUS6 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC149Q6ZUS6 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC149Q6ZUS6 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC149Q6ZUS6 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC149Q6ZUS6 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC149Q6ZUS6 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC149Q6ZUS6 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC149Q6ZUS6 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC149Q6ZUS6 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC149Q6ZUS6 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC149Q6ZUS6 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC149Q6ZUS6 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC149Q6ZUS6 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC149Q6ZUS6 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC149Q6ZUS6 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC149Q6ZUS6 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC149Q6ZUS6 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC149Q6ZUS6 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC149Q6ZUS6 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC149Q6ZUS6 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC149Q6ZUS6 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC149Q6ZUS6 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC149Q6ZUS6 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC149Q6ZUS6 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC149Q6ZUS6 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC149Q6ZUS6 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC149Q6ZUS6 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC149Q6ZUS6 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC149Q6ZUS6 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC149Q6ZUS6 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC149Q6ZUS6 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC149Q6ZUS6 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC149Q6ZUS6 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC149Q6ZUS6 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC149Q6ZUS6 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC149Q6ZUS6 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC149Q6ZUS6 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC149Q6ZUS6 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC149Q6ZUS6 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC149Q6ZUS6 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC149Q6ZUS6 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC149Q6ZUS6 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC149Q6ZUS6 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC149Q6ZUS6 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC149Q6ZUS6 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC149Q6ZUS6 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC149Q6ZUS6 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC149Q6ZUS6 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC149Q6ZUS6 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC149Q6ZUS6 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC149Q6ZUS6 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC149Q6ZUS6 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC149Q6ZUS6 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC149Q6ZUS6 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC149Q6ZUS6 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC149Q6ZUS6 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC149Q6ZUS6 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC149Q6ZUS6 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC149Q6ZUS6 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC149Q6ZUS6 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC149Q6ZUS6 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC149Q6ZUS6 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC149Q6ZUS6 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC149Q6ZUS6 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC149Q6ZUS6 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms