Protein–RNA interactions for Protein: Q6XE38

SCGB1D4, Secretoglobin family 1D member 4, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB1D4Q6XE38 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCGB1D4Q6XE38 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCGB1D4Q6XE38 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCGB1D4Q6XE38 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCGB1D4Q6XE38 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCGB1D4Q6XE38 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCGB1D4Q6XE38 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCGB1D4Q6XE38 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCGB1D4Q6XE38 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCGB1D4Q6XE38 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCGB1D4Q6XE38 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCGB1D4Q6XE38 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SCGB1D4Q6XE38 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCGB1D4Q6XE38 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCGB1D4Q6XE38 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCGB1D4Q6XE38 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCGB1D4Q6XE38 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCGB1D4Q6XE38 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCGB1D4Q6XE38 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCGB1D4Q6XE38 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCGB1D4Q6XE38 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCGB1D4Q6XE38 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCGB1D4Q6XE38 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCGB1D4Q6XE38 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCGB1D4Q6XE38 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCGB1D4Q6XE38 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCGB1D4Q6XE38 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCGB1D4Q6XE38 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCGB1D4Q6XE38 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCGB1D4Q6XE38 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCGB1D4Q6XE38 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCGB1D4Q6XE38 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCGB1D4Q6XE38 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCGB1D4Q6XE38 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCGB1D4Q6XE38 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCGB1D4Q6XE38 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCGB1D4Q6XE38 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCGB1D4Q6XE38 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCGB1D4Q6XE38 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCGB1D4Q6XE38 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCGB1D4Q6XE38 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCGB1D4Q6XE38 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCGB1D4Q6XE38 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCGB1D4Q6XE38 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCGB1D4Q6XE38 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCGB1D4Q6XE38 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCGB1D4Q6XE38 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCGB1D4Q6XE38 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCGB1D4Q6XE38 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCGB1D4Q6XE38 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCGB1D4Q6XE38 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCGB1D4Q6XE38 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCGB1D4Q6XE38 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCGB1D4Q6XE38 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCGB1D4Q6XE38 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCGB1D4Q6XE38 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCGB1D4Q6XE38 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCGB1D4Q6XE38 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCGB1D4Q6XE38 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCGB1D4Q6XE38 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCGB1D4Q6XE38 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCGB1D4Q6XE38 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCGB1D4Q6XE38 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCGB1D4Q6XE38 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCGB1D4Q6XE38 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCGB1D4Q6XE38 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCGB1D4Q6XE38 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCGB1D4Q6XE38 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCGB1D4Q6XE38 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCGB1D4Q6XE38 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCGB1D4Q6XE38 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCGB1D4Q6XE38 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCGB1D4Q6XE38 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCGB1D4Q6XE38 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCGB1D4Q6XE38 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCGB1D4Q6XE38 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCGB1D4Q6XE38 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCGB1D4Q6XE38 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCGB1D4Q6XE38 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCGB1D4Q6XE38 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCGB1D4Q6XE38 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCGB1D4Q6XE38 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCGB1D4Q6XE38 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCGB1D4Q6XE38 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SCGB1D4Q6XE38 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SCGB1D4Q6XE38 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SCGB1D4Q6XE38 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SCGB1D4Q6XE38 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SCGB1D4Q6XE38 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SCGB1D4Q6XE38 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SCGB1D4Q6XE38 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SCGB1D4Q6XE38 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SCGB1D4Q6XE38 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SCGB1D4Q6XE38 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SCGB1D4Q6XE38 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SCGB1D4Q6XE38 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SCGB1D4Q6XE38 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SCGB1D4Q6XE38 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SCGB1D4Q6XE38 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SCGB1D4Q6XE38 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms