Protein–RNA interactions for Protein: Q6VAB6

KSR2, Kinase suppressor of Ras 2, humanhuman

Predictions only

Length 950 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KSR2Q6VAB6 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
KSR2Q6VAB6 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
KSR2Q6VAB6 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
KSR2Q6VAB6 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
KSR2Q6VAB6 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
KSR2Q6VAB6 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
KSR2Q6VAB6 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
KSR2Q6VAB6 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
KSR2Q6VAB6 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
KSR2Q6VAB6 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
KSR2Q6VAB6 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
KSR2Q6VAB6 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
KSR2Q6VAB6 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.96
KSR2Q6VAB6 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
KSR2Q6VAB6 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
KSR2Q6VAB6 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
KSR2Q6VAB6 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
KSR2Q6VAB6 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
KSR2Q6VAB6 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
KSR2Q6VAB6 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
KSR2Q6VAB6 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
KSR2Q6VAB6 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
KSR2Q6VAB6 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
KSR2Q6VAB6 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
KSR2Q6VAB6 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
KSR2Q6VAB6 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
KSR2Q6VAB6 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
KSR2Q6VAB6 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
KSR2Q6VAB6 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
KSR2Q6VAB6 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
KSR2Q6VAB6 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
KSR2Q6VAB6 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
KSR2Q6VAB6 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
KSR2Q6VAB6 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
KSR2Q6VAB6 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
KSR2Q6VAB6 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
KSR2Q6VAB6 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC27.31■■□□□ 1.96
KSR2Q6VAB6 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
KSR2Q6VAB6 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
KSR2Q6VAB6 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
KSR2Q6VAB6 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
KSR2Q6VAB6 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
KSR2Q6VAB6 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
KSR2Q6VAB6 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
KSR2Q6VAB6 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
KSR2Q6VAB6 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
KSR2Q6VAB6 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
KSR2Q6VAB6 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
KSR2Q6VAB6 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
KSR2Q6VAB6 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
KSR2Q6VAB6 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
KSR2Q6VAB6 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
KSR2Q6VAB6 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
KSR2Q6VAB6 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
KSR2Q6VAB6 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
KSR2Q6VAB6 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
KSR2Q6VAB6 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
KSR2Q6VAB6 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
KSR2Q6VAB6 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
KSR2Q6VAB6 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
KSR2Q6VAB6 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
KSR2Q6VAB6 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
KSR2Q6VAB6 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
KSR2Q6VAB6 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
KSR2Q6VAB6 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
KSR2Q6VAB6 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
KSR2Q6VAB6 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
KSR2Q6VAB6 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
KSR2Q6VAB6 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
KSR2Q6VAB6 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
KSR2Q6VAB6 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
KSR2Q6VAB6 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
KSR2Q6VAB6 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
KSR2Q6VAB6 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
KSR2Q6VAB6 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
KSR2Q6VAB6 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
KSR2Q6VAB6 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
KSR2Q6VAB6 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
KSR2Q6VAB6 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
KSR2Q6VAB6 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
KSR2Q6VAB6 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
KSR2Q6VAB6 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
KSR2Q6VAB6 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
KSR2Q6VAB6 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
KSR2Q6VAB6 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
KSR2Q6VAB6 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
KSR2Q6VAB6 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
KSR2Q6VAB6 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
KSR2Q6VAB6 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
KSR2Q6VAB6 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
KSR2Q6VAB6 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
KSR2Q6VAB6 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
KSR2Q6VAB6 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
KSR2Q6VAB6 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
KSR2Q6VAB6 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
KSR2Q6VAB6 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
KSR2Q6VAB6 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC27.25■■□□□ 1.95
KSR2Q6VAB6 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
KSR2Q6VAB6 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
KSR2Q6VAB6 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms