Protein–RNA interactions for Protein: Q6UW56

ATRAID, All-trans retinoic acid-induced differentiation factor, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRAIDQ6UW56 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ATRAIDQ6UW56 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATRAIDQ6UW56 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATRAIDQ6UW56 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATRAIDQ6UW56 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATRAIDQ6UW56 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATRAIDQ6UW56 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATRAIDQ6UW56 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATRAIDQ6UW56 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATRAIDQ6UW56 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATRAIDQ6UW56 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ATRAIDQ6UW56 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ATRAIDQ6UW56 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATRAIDQ6UW56 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATRAIDQ6UW56 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATRAIDQ6UW56 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATRAIDQ6UW56 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATRAIDQ6UW56 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATRAIDQ6UW56 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATRAIDQ6UW56 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ATRAIDQ6UW56 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATRAIDQ6UW56 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATRAIDQ6UW56 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATRAIDQ6UW56 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATRAIDQ6UW56 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATRAIDQ6UW56 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATRAIDQ6UW56 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATRAIDQ6UW56 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATRAIDQ6UW56 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATRAIDQ6UW56 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATRAIDQ6UW56 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATRAIDQ6UW56 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATRAIDQ6UW56 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATRAIDQ6UW56 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATRAIDQ6UW56 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATRAIDQ6UW56 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATRAIDQ6UW56 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATRAIDQ6UW56 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATRAIDQ6UW56 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATRAIDQ6UW56 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATRAIDQ6UW56 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATRAIDQ6UW56 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATRAIDQ6UW56 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATRAIDQ6UW56 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATRAIDQ6UW56 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATRAIDQ6UW56 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATRAIDQ6UW56 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATRAIDQ6UW56 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATRAIDQ6UW56 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATRAIDQ6UW56 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATRAIDQ6UW56 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATRAIDQ6UW56 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATRAIDQ6UW56 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATRAIDQ6UW56 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ATRAIDQ6UW56 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATRAIDQ6UW56 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATRAIDQ6UW56 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATRAIDQ6UW56 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATRAIDQ6UW56 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATRAIDQ6UW56 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATRAIDQ6UW56 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATRAIDQ6UW56 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATRAIDQ6UW56 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATRAIDQ6UW56 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATRAIDQ6UW56 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATRAIDQ6UW56 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATRAIDQ6UW56 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATRAIDQ6UW56 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATRAIDQ6UW56 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATRAIDQ6UW56 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATRAIDQ6UW56 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATRAIDQ6UW56 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATRAIDQ6UW56 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATRAIDQ6UW56 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATRAIDQ6UW56 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATRAIDQ6UW56 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATRAIDQ6UW56 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATRAIDQ6UW56 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATRAIDQ6UW56 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATRAIDQ6UW56 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATRAIDQ6UW56 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATRAIDQ6UW56 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATRAIDQ6UW56 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATRAIDQ6UW56 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATRAIDQ6UW56 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATRAIDQ6UW56 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATRAIDQ6UW56 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATRAIDQ6UW56 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATRAIDQ6UW56 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATRAIDQ6UW56 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATRAIDQ6UW56 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATRAIDQ6UW56 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATRAIDQ6UW56 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATRAIDQ6UW56 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATRAIDQ6UW56 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATRAIDQ6UW56 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATRAIDQ6UW56 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATRAIDQ6UW56 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATRAIDQ6UW56 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATRAIDQ6UW56 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms