Protein–RNA interactions for Protein: Q6UVM3

KCNT2, Potassium channel subfamily T member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNT2Q6UVM3 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KCNT2Q6UVM3 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KCNT2Q6UVM3 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KCNT2Q6UVM3 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KCNT2Q6UVM3 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KCNT2Q6UVM3 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KCNT2Q6UVM3 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KCNT2Q6UVM3 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KCNT2Q6UVM3 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KCNT2Q6UVM3 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KCNT2Q6UVM3 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KCNT2Q6UVM3 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KCNT2Q6UVM3 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
KCNT2Q6UVM3 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KCNT2Q6UVM3 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KCNT2Q6UVM3 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KCNT2Q6UVM3 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
KCNT2Q6UVM3 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KCNT2Q6UVM3 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KCNT2Q6UVM3 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KCNT2Q6UVM3 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KCNT2Q6UVM3 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KCNT2Q6UVM3 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
KCNT2Q6UVM3 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KCNT2Q6UVM3 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KCNT2Q6UVM3 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KCNT2Q6UVM3 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KCNT2Q6UVM3 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KCNT2Q6UVM3 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KCNT2Q6UVM3 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KCNT2Q6UVM3 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KCNT2Q6UVM3 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KCNT2Q6UVM3 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KCNT2Q6UVM3 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KCNT2Q6UVM3 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KCNT2Q6UVM3 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KCNT2Q6UVM3 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KCNT2Q6UVM3 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KCNT2Q6UVM3 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KCNT2Q6UVM3 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
KCNT2Q6UVM3 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KCNT2Q6UVM3 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KCNT2Q6UVM3 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KCNT2Q6UVM3 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KCNT2Q6UVM3 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
KCNT2Q6UVM3 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
KCNT2Q6UVM3 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KCNT2Q6UVM3 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KCNT2Q6UVM3 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KCNT2Q6UVM3 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KCNT2Q6UVM3 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KCNT2Q6UVM3 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KCNT2Q6UVM3 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KCNT2Q6UVM3 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KCNT2Q6UVM3 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KCNT2Q6UVM3 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
KCNT2Q6UVM3 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KCNT2Q6UVM3 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KCNT2Q6UVM3 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KCNT2Q6UVM3 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KCNT2Q6UVM3 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
KCNT2Q6UVM3 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KCNT2Q6UVM3 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KCNT2Q6UVM3 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KCNT2Q6UVM3 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KCNT2Q6UVM3 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KCNT2Q6UVM3 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KCNT2Q6UVM3 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KCNT2Q6UVM3 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KCNT2Q6UVM3 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KCNT2Q6UVM3 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KCNT2Q6UVM3 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KCNT2Q6UVM3 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KCNT2Q6UVM3 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KCNT2Q6UVM3 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
KCNT2Q6UVM3 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KCNT2Q6UVM3 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KCNT2Q6UVM3 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KCNT2Q6UVM3 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KCNT2Q6UVM3 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KCNT2Q6UVM3 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KCNT2Q6UVM3 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KCNT2Q6UVM3 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KCNT2Q6UVM3 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KCNT2Q6UVM3 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCNT2Q6UVM3 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCNT2Q6UVM3 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCNT2Q6UVM3 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCNT2Q6UVM3 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCNT2Q6UVM3 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCNT2Q6UVM3 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCNT2Q6UVM3 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
KCNT2Q6UVM3 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCNT2Q6UVM3 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCNT2Q6UVM3 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCNT2Q6UVM3 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
KCNT2Q6UVM3 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCNT2Q6UVM3 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
KCNT2Q6UVM3 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCNT2Q6UVM3 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms