Protein–RNA interactions for Protein: Q6UN15

FIP1L1, Pre-mRNA 3'-end-processing factor FIP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FIP1L1Q6UN15 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FIP1L1Q6UN15 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FIP1L1Q6UN15 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FIP1L1Q6UN15 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FIP1L1Q6UN15 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FIP1L1Q6UN15 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FIP1L1Q6UN15 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FIP1L1Q6UN15 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
FIP1L1Q6UN15 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
FIP1L1Q6UN15 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
FIP1L1Q6UN15 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
FIP1L1Q6UN15 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FIP1L1Q6UN15 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FIP1L1Q6UN15 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FIP1L1Q6UN15 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FIP1L1Q6UN15 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FIP1L1Q6UN15 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FIP1L1Q6UN15 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FIP1L1Q6UN15 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FIP1L1Q6UN15 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FIP1L1Q6UN15 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FIP1L1Q6UN15 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
FIP1L1Q6UN15 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FIP1L1Q6UN15 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FIP1L1Q6UN15 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FIP1L1Q6UN15 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FIP1L1Q6UN15 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FIP1L1Q6UN15 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FIP1L1Q6UN15 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FIP1L1Q6UN15 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FIP1L1Q6UN15 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FIP1L1Q6UN15 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FIP1L1Q6UN15 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FIP1L1Q6UN15 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
FIP1L1Q6UN15 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FIP1L1Q6UN15 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FIP1L1Q6UN15 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
FIP1L1Q6UN15 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FIP1L1Q6UN15 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FIP1L1Q6UN15 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FIP1L1Q6UN15 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FIP1L1Q6UN15 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
FIP1L1Q6UN15 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FIP1L1Q6UN15 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
FIP1L1Q6UN15 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
FIP1L1Q6UN15 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FIP1L1Q6UN15 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FIP1L1Q6UN15 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FIP1L1Q6UN15 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FIP1L1Q6UN15 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FIP1L1Q6UN15 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FIP1L1Q6UN15 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FIP1L1Q6UN15 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FIP1L1Q6UN15 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FIP1L1Q6UN15 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FIP1L1Q6UN15 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FIP1L1Q6UN15 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FIP1L1Q6UN15 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FIP1L1Q6UN15 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
FIP1L1Q6UN15 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FIP1L1Q6UN15 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FIP1L1Q6UN15 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FIP1L1Q6UN15 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
FIP1L1Q6UN15 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FIP1L1Q6UN15 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FIP1L1Q6UN15 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FIP1L1Q6UN15 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FIP1L1Q6UN15 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FIP1L1Q6UN15 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FIP1L1Q6UN15 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FIP1L1Q6UN15 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FIP1L1Q6UN15 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FIP1L1Q6UN15 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FIP1L1Q6UN15 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FIP1L1Q6UN15 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FIP1L1Q6UN15 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FIP1L1Q6UN15 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FIP1L1Q6UN15 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FIP1L1Q6UN15 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FIP1L1Q6UN15 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FIP1L1Q6UN15 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FIP1L1Q6UN15 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FIP1L1Q6UN15 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FIP1L1Q6UN15 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FIP1L1Q6UN15 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FIP1L1Q6UN15 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FIP1L1Q6UN15 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FIP1L1Q6UN15 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FIP1L1Q6UN15 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
FIP1L1Q6UN15 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.54
FIP1L1Q6UN15 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FIP1L1Q6UN15 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FIP1L1Q6UN15 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FIP1L1Q6UN15 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FIP1L1Q6UN15 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FIP1L1Q6UN15 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FIP1L1Q6UN15 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
FIP1L1Q6UN15 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FIP1L1Q6UN15 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FIP1L1Q6UN15 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms