Protein–RNA interactions for Protein: Q6SPF0

SAMD1, Atherin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD1Q6SPF0 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SAMD1Q6SPF0 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SAMD1Q6SPF0 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SAMD1Q6SPF0 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SAMD1Q6SPF0 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SAMD1Q6SPF0 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
SAMD1Q6SPF0 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
SAMD1Q6SPF0 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SAMD1Q6SPF0 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SAMD1Q6SPF0 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SAMD1Q6SPF0 AC005786.4-201ENST00000623369 682 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SAMD1Q6SPF0 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SAMD1Q6SPF0 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SAMD1Q6SPF0 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SAMD1Q6SPF0 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SAMD1Q6SPF0 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SAMD1Q6SPF0 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SAMD1Q6SPF0 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SAMD1Q6SPF0 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SAMD1Q6SPF0 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SAMD1Q6SPF0 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SAMD1Q6SPF0 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SAMD1Q6SPF0 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SAMD1Q6SPF0 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SAMD1Q6SPF0 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SAMD1Q6SPF0 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SAMD1Q6SPF0 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SAMD1Q6SPF0 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SAMD1Q6SPF0 MTND4LP12-201ENST00000448237 295 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SAMD1Q6SPF0 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SAMD1Q6SPF0 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SAMD1Q6SPF0 AL390728.6-201ENST00000566446 1246 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SAMD1Q6SPF0 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SAMD1Q6SPF0 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SAMD1Q6SPF0 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SAMD1Q6SPF0 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SAMD1Q6SPF0 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SAMD1Q6SPF0 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SAMD1Q6SPF0 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SAMD1Q6SPF0 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SAMD1Q6SPF0 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SAMD1Q6SPF0 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SAMD1Q6SPF0 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SAMD1Q6SPF0 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SAMD1Q6SPF0 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SAMD1Q6SPF0 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SAMD1Q6SPF0 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SAMD1Q6SPF0 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SAMD1Q6SPF0 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SAMD1Q6SPF0 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SAMD1Q6SPF0 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SAMD1Q6SPF0 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SAMD1Q6SPF0 FMC1-201ENST00000297534 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SAMD1Q6SPF0 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SAMD1Q6SPF0 LINC00437-201ENST00000414161 791 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SAMD1Q6SPF0 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SAMD1Q6SPF0 AC090142.2-201ENST00000483263 416 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SAMD1Q6SPF0 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SAMD1Q6SPF0 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SAMD1Q6SPF0 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SAMD1Q6SPF0 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SAMD1Q6SPF0 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SAMD1Q6SPF0 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SAMD1Q6SPF0 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SAMD1Q6SPF0 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SAMD1Q6SPF0 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SAMD1Q6SPF0 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SAMD1Q6SPF0 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SAMD1Q6SPF0 AP003400.6-201ENST00000624698 740 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SAMD1Q6SPF0 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SAMD1Q6SPF0 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SAMD1Q6SPF0 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SAMD1Q6SPF0 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SAMD1Q6SPF0 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SAMD1Q6SPF0 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SAMD1Q6SPF0 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SAMD1Q6SPF0 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SAMD1Q6SPF0 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SAMD1Q6SPF0 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SAMD1Q6SPF0 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SAMD1Q6SPF0 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SAMD1Q6SPF0 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SAMD1Q6SPF0 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SAMD1Q6SPF0 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SAMD1Q6SPF0 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SAMD1Q6SPF0 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SAMD1Q6SPF0 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SAMD1Q6SPF0 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SAMD1Q6SPF0 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SAMD1Q6SPF0 AC012497.1-201ENST00000429392 575 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SAMD1Q6SPF0 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SAMD1Q6SPF0 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SAMD1Q6SPF0 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SAMD1Q6SPF0 BNIP3P41-202ENST00000616656 861 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SAMD1Q6SPF0 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SAMD1Q6SPF0 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SAMD1Q6SPF0 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SAMD1Q6SPF0 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SAMD1Q6SPF0 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SAMD1Q6SPF0 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms