Protein–RNA interactions for Protein: Q6P597

KLC3, Kinesin light chain 3, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLC3Q6P597 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLC3Q6P597 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLC3Q6P597 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLC3Q6P597 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
KLC3Q6P597 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLC3Q6P597 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLC3Q6P597 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLC3Q6P597 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLC3Q6P597 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLC3Q6P597 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLC3Q6P597 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLC3Q6P597 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLC3Q6P597 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLC3Q6P597 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLC3Q6P597 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLC3Q6P597 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLC3Q6P597 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLC3Q6P597 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLC3Q6P597 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLC3Q6P597 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
KLC3Q6P597 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLC3Q6P597 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLC3Q6P597 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLC3Q6P597 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLC3Q6P597 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
KLC3Q6P597 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLC3Q6P597 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLC3Q6P597 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLC3Q6P597 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLC3Q6P597 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLC3Q6P597 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLC3Q6P597 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLC3Q6P597 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLC3Q6P597 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLC3Q6P597 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
KLC3Q6P597 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLC3Q6P597 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
KLC3Q6P597 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLC3Q6P597 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLC3Q6P597 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLC3Q6P597 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLC3Q6P597 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLC3Q6P597 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLC3Q6P597 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLC3Q6P597 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLC3Q6P597 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLC3Q6P597 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLC3Q6P597 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLC3Q6P597 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLC3Q6P597 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLC3Q6P597 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLC3Q6P597 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLC3Q6P597 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
KLC3Q6P597 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
KLC3Q6P597 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
KLC3Q6P597 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
KLC3Q6P597 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLC3Q6P597 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLC3Q6P597 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLC3Q6P597 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLC3Q6P597 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLC3Q6P597 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLC3Q6P597 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLC3Q6P597 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLC3Q6P597 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLC3Q6P597 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLC3Q6P597 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLC3Q6P597 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLC3Q6P597 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLC3Q6P597 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLC3Q6P597 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
KLC3Q6P597 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLC3Q6P597 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLC3Q6P597 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLC3Q6P597 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLC3Q6P597 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
KLC3Q6P597 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
KLC3Q6P597 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
KLC3Q6P597 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
KLC3Q6P597 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KLC3Q6P597 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KLC3Q6P597 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KLC3Q6P597 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KLC3Q6P597 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
KLC3Q6P597 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KLC3Q6P597 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLC3Q6P597 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLC3Q6P597 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLC3Q6P597 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLC3Q6P597 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLC3Q6P597 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLC3Q6P597 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLC3Q6P597 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLC3Q6P597 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLC3Q6P597 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLC3Q6P597 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
KLC3Q6P597 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLC3Q6P597 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLC3Q6P597 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLC3Q6P597 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms