Protein–RNA interactions for Protein: Q6KF10

GDF6, Growth/differentiation factor 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF6Q6KF10 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
GDF6Q6KF10 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GDF6Q6KF10 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GDF6Q6KF10 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
GDF6Q6KF10 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
GDF6Q6KF10 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
GDF6Q6KF10 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GDF6Q6KF10 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GDF6Q6KF10 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GDF6Q6KF10 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
GDF6Q6KF10 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GDF6Q6KF10 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GDF6Q6KF10 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GDF6Q6KF10 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GDF6Q6KF10 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GDF6Q6KF10 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GDF6Q6KF10 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GDF6Q6KF10 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GDF6Q6KF10 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GDF6Q6KF10 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
GDF6Q6KF10 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GDF6Q6KF10 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GDF6Q6KF10 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GDF6Q6KF10 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
GDF6Q6KF10 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GDF6Q6KF10 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GDF6Q6KF10 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
GDF6Q6KF10 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GDF6Q6KF10 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GDF6Q6KF10 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GDF6Q6KF10 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GDF6Q6KF10 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GDF6Q6KF10 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GDF6Q6KF10 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GDF6Q6KF10 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GDF6Q6KF10 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GDF6Q6KF10 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GDF6Q6KF10 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GDF6Q6KF10 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GDF6Q6KF10 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GDF6Q6KF10 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GDF6Q6KF10 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GDF6Q6KF10 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GDF6Q6KF10 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GDF6Q6KF10 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GDF6Q6KF10 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GDF6Q6KF10 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GDF6Q6KF10 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GDF6Q6KF10 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GDF6Q6KF10 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GDF6Q6KF10 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GDF6Q6KF10 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GDF6Q6KF10 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GDF6Q6KF10 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GDF6Q6KF10 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GDF6Q6KF10 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GDF6Q6KF10 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GDF6Q6KF10 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GDF6Q6KF10 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GDF6Q6KF10 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GDF6Q6KF10 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GDF6Q6KF10 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GDF6Q6KF10 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GDF6Q6KF10 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GDF6Q6KF10 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GDF6Q6KF10 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GDF6Q6KF10 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GDF6Q6KF10 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GDF6Q6KF10 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
GDF6Q6KF10 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GDF6Q6KF10 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GDF6Q6KF10 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GDF6Q6KF10 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GDF6Q6KF10 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GDF6Q6KF10 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GDF6Q6KF10 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GDF6Q6KF10 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GDF6Q6KF10 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GDF6Q6KF10 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
GDF6Q6KF10 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GDF6Q6KF10 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GDF6Q6KF10 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GDF6Q6KF10 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GDF6Q6KF10 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
GDF6Q6KF10 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GDF6Q6KF10 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GDF6Q6KF10 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
GDF6Q6KF10 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GDF6Q6KF10 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GDF6Q6KF10 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GDF6Q6KF10 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GDF6Q6KF10 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GDF6Q6KF10 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GDF6Q6KF10 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GDF6Q6KF10 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GDF6Q6KF10 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GDF6Q6KF10 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GDF6Q6KF10 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GDF6Q6KF10 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GDF6Q6KF10 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms