Protein–RNA interactions for Protein: Q6GYQ0

RALGAPA1, Ral GTPase-activating protein subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 2,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALGAPA1Q6GYQ0 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RALGAPA1Q6GYQ0 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RALGAPA1Q6GYQ0 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RALGAPA1Q6GYQ0 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RALGAPA1Q6GYQ0 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
RALGAPA1Q6GYQ0 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RALGAPA1Q6GYQ0 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RALGAPA1Q6GYQ0 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RALGAPA1Q6GYQ0 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RALGAPA1Q6GYQ0 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RALGAPA1Q6GYQ0 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RALGAPA1Q6GYQ0 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RALGAPA1Q6GYQ0 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RALGAPA1Q6GYQ0 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RALGAPA1Q6GYQ0 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RALGAPA1Q6GYQ0 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RALGAPA1Q6GYQ0 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RALGAPA1Q6GYQ0 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RALGAPA1Q6GYQ0 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RALGAPA1Q6GYQ0 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RALGAPA1Q6GYQ0 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RALGAPA1Q6GYQ0 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RALGAPA1Q6GYQ0 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RALGAPA1Q6GYQ0 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RALGAPA1Q6GYQ0 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RALGAPA1Q6GYQ0 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
RALGAPA1Q6GYQ0 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RALGAPA1Q6GYQ0 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RALGAPA1Q6GYQ0 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RALGAPA1Q6GYQ0 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RALGAPA1Q6GYQ0 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RALGAPA1Q6GYQ0 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RALGAPA1Q6GYQ0 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
RALGAPA1Q6GYQ0 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RALGAPA1Q6GYQ0 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RALGAPA1Q6GYQ0 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RALGAPA1Q6GYQ0 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.32■■□□□ 1
RALGAPA1Q6GYQ0 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RALGAPA1Q6GYQ0 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RALGAPA1Q6GYQ0 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RALGAPA1Q6GYQ0 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RALGAPA1Q6GYQ0 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RALGAPA1Q6GYQ0 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
RALGAPA1Q6GYQ0 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RALGAPA1Q6GYQ0 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RALGAPA1Q6GYQ0 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RALGAPA1Q6GYQ0 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
RALGAPA1Q6GYQ0 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
RALGAPA1Q6GYQ0 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.32■■□□□ 1
RALGAPA1Q6GYQ0 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RALGAPA1Q6GYQ0 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RALGAPA1Q6GYQ0 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RALGAPA1Q6GYQ0 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RALGAPA1Q6GYQ0 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RALGAPA1Q6GYQ0 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RALGAPA1Q6GYQ0 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RALGAPA1Q6GYQ0 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RALGAPA1Q6GYQ0 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RALGAPA1Q6GYQ0 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RALGAPA1Q6GYQ0 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
RALGAPA1Q6GYQ0 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RALGAPA1Q6GYQ0 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RALGAPA1Q6GYQ0 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RALGAPA1Q6GYQ0 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RALGAPA1Q6GYQ0 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RALGAPA1Q6GYQ0 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RALGAPA1Q6GYQ0 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RALGAPA1Q6GYQ0 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC21.31■■□□□ 1
RALGAPA1Q6GYQ0 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RALGAPA1Q6GYQ0 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
RALGAPA1Q6GYQ0 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RALGAPA1Q6GYQ0 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RALGAPA1Q6GYQ0 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RALGAPA1Q6GYQ0 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RALGAPA1Q6GYQ0 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RALGAPA1Q6GYQ0 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RALGAPA1Q6GYQ0 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RALGAPA1Q6GYQ0 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RALGAPA1Q6GYQ0 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RALGAPA1Q6GYQ0 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC21.3■■□□□ 1
RALGAPA1Q6GYQ0 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC21.3■■□□□ 1
RALGAPA1Q6GYQ0 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
RALGAPA1Q6GYQ0 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RALGAPA1Q6GYQ0 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RALGAPA1Q6GYQ0 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RALGAPA1Q6GYQ0 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RALGAPA1Q6GYQ0 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RALGAPA1Q6GYQ0 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RALGAPA1Q6GYQ0 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
RALGAPA1Q6GYQ0 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RALGAPA1Q6GYQ0 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RALGAPA1Q6GYQ0 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RALGAPA1Q6GYQ0 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RALGAPA1Q6GYQ0 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RALGAPA1Q6GYQ0 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RALGAPA1Q6GYQ0 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RALGAPA1Q6GYQ0 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RALGAPA1Q6GYQ0 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RALGAPA1Q6GYQ0 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RALGAPA1Q6GYQ0 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms