Protein–RNA interactions for Protein: Q6DD88

ATL3, Atlastin-3, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL3Q6DD88 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATL3Q6DD88 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATL3Q6DD88 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATL3Q6DD88 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
ATL3Q6DD88 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATL3Q6DD88 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATL3Q6DD88 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATL3Q6DD88 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATL3Q6DD88 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATL3Q6DD88 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATL3Q6DD88 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATL3Q6DD88 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATL3Q6DD88 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATL3Q6DD88 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATL3Q6DD88 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATL3Q6DD88 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATL3Q6DD88 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATL3Q6DD88 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATL3Q6DD88 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATL3Q6DD88 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.55
ATL3Q6DD88 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ATL3Q6DD88 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
ATL3Q6DD88 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ATL3Q6DD88 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATL3Q6DD88 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATL3Q6DD88 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATL3Q6DD88 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATL3Q6DD88 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATL3Q6DD88 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATL3Q6DD88 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATL3Q6DD88 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATL3Q6DD88 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATL3Q6DD88 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
ATL3Q6DD88 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATL3Q6DD88 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATL3Q6DD88 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
ATL3Q6DD88 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATL3Q6DD88 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
ATL3Q6DD88 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATL3Q6DD88 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATL3Q6DD88 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATL3Q6DD88 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATL3Q6DD88 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATL3Q6DD88 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATL3Q6DD88 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATL3Q6DD88 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATL3Q6DD88 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATL3Q6DD88 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATL3Q6DD88 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATL3Q6DD88 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATL3Q6DD88 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
ATL3Q6DD88 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATL3Q6DD88 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATL3Q6DD88 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATL3Q6DD88 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATL3Q6DD88 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATL3Q6DD88 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATL3Q6DD88 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATL3Q6DD88 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATL3Q6DD88 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATL3Q6DD88 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATL3Q6DD88 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
ATL3Q6DD88 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATL3Q6DD88 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATL3Q6DD88 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATL3Q6DD88 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATL3Q6DD88 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATL3Q6DD88 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATL3Q6DD88 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
ATL3Q6DD88 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATL3Q6DD88 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATL3Q6DD88 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATL3Q6DD88 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATL3Q6DD88 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATL3Q6DD88 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATL3Q6DD88 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATL3Q6DD88 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATL3Q6DD88 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATL3Q6DD88 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATL3Q6DD88 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATL3Q6DD88 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
ATL3Q6DD88 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATL3Q6DD88 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATL3Q6DD88 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATL3Q6DD88 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
ATL3Q6DD88 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATL3Q6DD88 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATL3Q6DD88 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATL3Q6DD88 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATL3Q6DD88 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATL3Q6DD88 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATL3Q6DD88 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATL3Q6DD88 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ATL3Q6DD88 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ATL3Q6DD88 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ATL3Q6DD88 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATL3Q6DD88 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATL3Q6DD88 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATL3Q6DD88 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATL3Q6DD88 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms