Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ANKRD40Q6AI12 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ANKRD40Q6AI12 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ANKRD40Q6AI12 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ANKRD40Q6AI12 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ANKRD40Q6AI12 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ANKRD40Q6AI12 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ANKRD40Q6AI12 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ANKRD40Q6AI12 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ANKRD40Q6AI12 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ANKRD40Q6AI12 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ANKRD40Q6AI12 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ANKRD40Q6AI12 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ANKRD40Q6AI12 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ANKRD40Q6AI12 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ANKRD40Q6AI12 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ANKRD40Q6AI12 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ANKRD40Q6AI12 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ANKRD40Q6AI12 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ANKRD40Q6AI12 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
ANKRD40Q6AI12 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ANKRD40Q6AI12 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ANKRD40Q6AI12 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ANKRD40Q6AI12 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ANKRD40Q6AI12 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ANKRD40Q6AI12 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
ANKRD40Q6AI12 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
ANKRD40Q6AI12 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ANKRD40Q6AI12 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ANKRD40Q6AI12 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ANKRD40Q6AI12 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ANKRD40Q6AI12 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ANKRD40Q6AI12 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ANKRD40Q6AI12 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ANKRD40Q6AI12 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ANKRD40Q6AI12 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ANKRD40Q6AI12 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
ANKRD40Q6AI12 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ANKRD40Q6AI12 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ANKRD40Q6AI12 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ANKRD40Q6AI12 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
ANKRD40Q6AI12 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ANKRD40Q6AI12 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ANKRD40Q6AI12 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ANKRD40Q6AI12 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ANKRD40Q6AI12 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ANKRD40Q6AI12 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ANKRD40Q6AI12 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ANKRD40Q6AI12 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ANKRD40Q6AI12 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ANKRD40Q6AI12 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ANKRD40Q6AI12 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ANKRD40Q6AI12 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ANKRD40Q6AI12 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ANKRD40Q6AI12 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ANKRD40Q6AI12 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
ANKRD40Q6AI12 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
ANKRD40Q6AI12 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ANKRD40Q6AI12 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ANKRD40Q6AI12 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ANKRD40Q6AI12 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ANKRD40Q6AI12 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
ANKRD40Q6AI12 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ANKRD40Q6AI12 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ANKRD40Q6AI12 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
ANKRD40Q6AI12 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ANKRD40Q6AI12 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ANKRD40Q6AI12 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ANKRD40Q6AI12 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ANKRD40Q6AI12 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
ANKRD40Q6AI12 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ANKRD40Q6AI12 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ANKRD40Q6AI12 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ANKRD40Q6AI12 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ANKRD40Q6AI12 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ANKRD40Q6AI12 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ANKRD40Q6AI12 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ANKRD40Q6AI12 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ANKRD40Q6AI12 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ANKRD40Q6AI12 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ANKRD40Q6AI12 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ANKRD40Q6AI12 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ANKRD40Q6AI12 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ANKRD40Q6AI12 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ANKRD40Q6AI12 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ANKRD40Q6AI12 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ANKRD40Q6AI12 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ANKRD40Q6AI12 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ANKRD40Q6AI12 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ANKRD40Q6AI12 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ANKRD40Q6AI12 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ANKRD40Q6AI12 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
ANKRD40Q6AI12 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ANKRD40Q6AI12 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ANKRD40Q6AI12 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ANKRD40Q6AI12 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ANKRD40Q6AI12 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ANKRD40Q6AI12 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ANKRD40Q6AI12 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ANKRD40Q6AI12 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms