Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUJ6

LRCH2, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRCH2Q5VUJ6 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRCH2Q5VUJ6 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRCH2Q5VUJ6 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRCH2Q5VUJ6 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRCH2Q5VUJ6 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRCH2Q5VUJ6 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRCH2Q5VUJ6 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
LRCH2Q5VUJ6 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
LRCH2Q5VUJ6 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRCH2Q5VUJ6 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
LRCH2Q5VUJ6 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRCH2Q5VUJ6 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRCH2Q5VUJ6 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRCH2Q5VUJ6 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRCH2Q5VUJ6 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRCH2Q5VUJ6 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
LRCH2Q5VUJ6 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRCH2Q5VUJ6 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRCH2Q5VUJ6 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRCH2Q5VUJ6 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRCH2Q5VUJ6 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRCH2Q5VUJ6 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRCH2Q5VUJ6 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRCH2Q5VUJ6 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRCH2Q5VUJ6 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRCH2Q5VUJ6 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRCH2Q5VUJ6 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRCH2Q5VUJ6 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRCH2Q5VUJ6 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRCH2Q5VUJ6 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRCH2Q5VUJ6 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRCH2Q5VUJ6 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRCH2Q5VUJ6 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRCH2Q5VUJ6 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRCH2Q5VUJ6 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRCH2Q5VUJ6 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRCH2Q5VUJ6 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRCH2Q5VUJ6 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRCH2Q5VUJ6 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRCH2Q5VUJ6 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRCH2Q5VUJ6 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRCH2Q5VUJ6 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRCH2Q5VUJ6 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRCH2Q5VUJ6 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
LRCH2Q5VUJ6 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRCH2Q5VUJ6 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRCH2Q5VUJ6 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRCH2Q5VUJ6 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRCH2Q5VUJ6 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRCH2Q5VUJ6 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRCH2Q5VUJ6 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRCH2Q5VUJ6 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
LRCH2Q5VUJ6 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRCH2Q5VUJ6 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRCH2Q5VUJ6 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRCH2Q5VUJ6 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRCH2Q5VUJ6 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRCH2Q5VUJ6 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRCH2Q5VUJ6 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRCH2Q5VUJ6 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRCH2Q5VUJ6 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRCH2Q5VUJ6 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRCH2Q5VUJ6 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRCH2Q5VUJ6 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
LRCH2Q5VUJ6 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.48
LRCH2Q5VUJ6 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRCH2Q5VUJ6 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRCH2Q5VUJ6 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRCH2Q5VUJ6 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRCH2Q5VUJ6 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRCH2Q5VUJ6 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRCH2Q5VUJ6 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRCH2Q5VUJ6 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRCH2Q5VUJ6 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRCH2Q5VUJ6 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRCH2Q5VUJ6 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRCH2Q5VUJ6 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRCH2Q5VUJ6 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRCH2Q5VUJ6 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRCH2Q5VUJ6 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
LRCH2Q5VUJ6 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
LRCH2Q5VUJ6 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRCH2Q5VUJ6 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRCH2Q5VUJ6 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRCH2Q5VUJ6 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRCH2Q5VUJ6 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRCH2Q5VUJ6 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRCH2Q5VUJ6 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
LRCH2Q5VUJ6 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRCH2Q5VUJ6 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRCH2Q5VUJ6 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRCH2Q5VUJ6 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRCH2Q5VUJ6 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRCH2Q5VUJ6 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRCH2Q5VUJ6 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRCH2Q5VUJ6 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
LRCH2Q5VUJ6 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
LRCH2Q5VUJ6 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRCH2Q5VUJ6 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
LRCH2Q5VUJ6 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms