Protein–RNA interactions for Protein: Q5U649

C12orf60, Uncharacterized protein C12orf60, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C12orf60Q5U649 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
C12orf60Q5U649 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
C12orf60Q5U649 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
C12orf60Q5U649 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
C12orf60Q5U649 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
C12orf60Q5U649 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
C12orf60Q5U649 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
C12orf60Q5U649 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
C12orf60Q5U649 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
C12orf60Q5U649 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
C12orf60Q5U649 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
C12orf60Q5U649 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
C12orf60Q5U649 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
C12orf60Q5U649 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
C12orf60Q5U649 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
C12orf60Q5U649 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
C12orf60Q5U649 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
C12orf60Q5U649 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
C12orf60Q5U649 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
C12orf60Q5U649 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
C12orf60Q5U649 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
C12orf60Q5U649 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
C12orf60Q5U649 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
C12orf60Q5U649 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
C12orf60Q5U649 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
C12orf60Q5U649 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
C12orf60Q5U649 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
C12orf60Q5U649 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
C12orf60Q5U649 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
C12orf60Q5U649 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
C12orf60Q5U649 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
C12orf60Q5U649 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
C12orf60Q5U649 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
C12orf60Q5U649 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
C12orf60Q5U649 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
C12orf60Q5U649 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
C12orf60Q5U649 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
C12orf60Q5U649 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
C12orf60Q5U649 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
C12orf60Q5U649 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
C12orf60Q5U649 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
C12orf60Q5U649 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
C12orf60Q5U649 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
C12orf60Q5U649 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
C12orf60Q5U649 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
C12orf60Q5U649 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
C12orf60Q5U649 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
C12orf60Q5U649 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
C12orf60Q5U649 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
C12orf60Q5U649 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
C12orf60Q5U649 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
C12orf60Q5U649 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
C12orf60Q5U649 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
C12orf60Q5U649 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
C12orf60Q5U649 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
C12orf60Q5U649 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
C12orf60Q5U649 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
C12orf60Q5U649 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
C12orf60Q5U649 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
C12orf60Q5U649 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
C12orf60Q5U649 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
C12orf60Q5U649 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
C12orf60Q5U649 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
C12orf60Q5U649 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
C12orf60Q5U649 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
C12orf60Q5U649 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
C12orf60Q5U649 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
C12orf60Q5U649 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
C12orf60Q5U649 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
C12orf60Q5U649 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
C12orf60Q5U649 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
C12orf60Q5U649 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
C12orf60Q5U649 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
C12orf60Q5U649 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
C12orf60Q5U649 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
C12orf60Q5U649 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
C12orf60Q5U649 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
C12orf60Q5U649 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
C12orf60Q5U649 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
C12orf60Q5U649 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
C12orf60Q5U649 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
C12orf60Q5U649 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
C12orf60Q5U649 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
C12orf60Q5U649 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
C12orf60Q5U649 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
C12orf60Q5U649 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
C12orf60Q5U649 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
C12orf60Q5U649 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
C12orf60Q5U649 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
C12orf60Q5U649 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
C12orf60Q5U649 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
C12orf60Q5U649 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
C12orf60Q5U649 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
C12orf60Q5U649 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
C12orf60Q5U649 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
C12orf60Q5U649 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
C12orf60Q5U649 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
C12orf60Q5U649 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
C12orf60Q5U649 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
C12orf60Q5U649 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.7 ms