Protein–RNA interactions for Protein: Q5T5S1

CCDC183, Coiled-coil domain-containing protein 183, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC183Q5T5S1 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC183Q5T5S1 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC183Q5T5S1 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC183Q5T5S1 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC183Q5T5S1 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC183Q5T5S1 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC183Q5T5S1 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC183Q5T5S1 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC183Q5T5S1 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC183Q5T5S1 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC183Q5T5S1 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC183Q5T5S1 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC183Q5T5S1 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC183Q5T5S1 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC183Q5T5S1 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC183Q5T5S1 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC183Q5T5S1 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC183Q5T5S1 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC183Q5T5S1 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC183Q5T5S1 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC183Q5T5S1 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC183Q5T5S1 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC183Q5T5S1 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC183Q5T5S1 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC183Q5T5S1 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC183Q5T5S1 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC183Q5T5S1 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC183Q5T5S1 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC183Q5T5S1 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC183Q5T5S1 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC183Q5T5S1 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC183Q5T5S1 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC183Q5T5S1 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC183Q5T5S1 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC183Q5T5S1 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC183Q5T5S1 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC183Q5T5S1 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC183Q5T5S1 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC183Q5T5S1 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC183Q5T5S1 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC183Q5T5S1 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC183Q5T5S1 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC183Q5T5S1 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC183Q5T5S1 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC183Q5T5S1 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC183Q5T5S1 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC183Q5T5S1 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC183Q5T5S1 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC183Q5T5S1 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC183Q5T5S1 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC183Q5T5S1 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC183Q5T5S1 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC183Q5T5S1 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC183Q5T5S1 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC183Q5T5S1 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC183Q5T5S1 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC183Q5T5S1 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC183Q5T5S1 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC183Q5T5S1 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC183Q5T5S1 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC183Q5T5S1 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC183Q5T5S1 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC183Q5T5S1 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC183Q5T5S1 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC183Q5T5S1 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC183Q5T5S1 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC183Q5T5S1 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC183Q5T5S1 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC183Q5T5S1 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC183Q5T5S1 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC183Q5T5S1 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC183Q5T5S1 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC183Q5T5S1 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC183Q5T5S1 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC183Q5T5S1 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC183Q5T5S1 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC183Q5T5S1 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC183Q5T5S1 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC183Q5T5S1 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC183Q5T5S1 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC183Q5T5S1 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC183Q5T5S1 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC183Q5T5S1 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC183Q5T5S1 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC183Q5T5S1 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC183Q5T5S1 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC183Q5T5S1 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC183Q5T5S1 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC183Q5T5S1 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC183Q5T5S1 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC183Q5T5S1 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC183Q5T5S1 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC183Q5T5S1 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC183Q5T5S1 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC183Q5T5S1 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC183Q5T5S1 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC183Q5T5S1 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC183Q5T5S1 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC183Q5T5S1 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC183Q5T5S1 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.2 ms