Protein–RNA interactions for Protein: Q5SY13

COL5A1-AS1, Putative uncharacterized protein encoded by COL5A1-AS1, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL5A1-AS1Q5SY13 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
COL5A1-AS1Q5SY13 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
COL5A1-AS1Q5SY13 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
COL5A1-AS1Q5SY13 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
COL5A1-AS1Q5SY13 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
COL5A1-AS1Q5SY13 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
COL5A1-AS1Q5SY13 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
COL5A1-AS1Q5SY13 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
COL5A1-AS1Q5SY13 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
COL5A1-AS1Q5SY13 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
COL5A1-AS1Q5SY13 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
COL5A1-AS1Q5SY13 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
COL5A1-AS1Q5SY13 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COL5A1-AS1Q5SY13 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COL5A1-AS1Q5SY13 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COL5A1-AS1Q5SY13 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COL5A1-AS1Q5SY13 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COL5A1-AS1Q5SY13 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COL5A1-AS1Q5SY13 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COL5A1-AS1Q5SY13 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COL5A1-AS1Q5SY13 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COL5A1-AS1Q5SY13 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COL5A1-AS1Q5SY13 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COL5A1-AS1Q5SY13 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
COL5A1-AS1Q5SY13 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COL5A1-AS1Q5SY13 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COL5A1-AS1Q5SY13 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COL5A1-AS1Q5SY13 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COL5A1-AS1Q5SY13 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COL5A1-AS1Q5SY13 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
COL5A1-AS1Q5SY13 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COL5A1-AS1Q5SY13 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COL5A1-AS1Q5SY13 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COL5A1-AS1Q5SY13 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COL5A1-AS1Q5SY13 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COL5A1-AS1Q5SY13 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COL5A1-AS1Q5SY13 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COL5A1-AS1Q5SY13 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COL5A1-AS1Q5SY13 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COL5A1-AS1Q5SY13 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COL5A1-AS1Q5SY13 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COL5A1-AS1Q5SY13 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COL5A1-AS1Q5SY13 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COL5A1-AS1Q5SY13 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COL5A1-AS1Q5SY13 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COL5A1-AS1Q5SY13 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
COL5A1-AS1Q5SY13 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COL5A1-AS1Q5SY13 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COL5A1-AS1Q5SY13 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COL5A1-AS1Q5SY13 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COL5A1-AS1Q5SY13 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COL5A1-AS1Q5SY13 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COL5A1-AS1Q5SY13 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COL5A1-AS1Q5SY13 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COL5A1-AS1Q5SY13 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COL5A1-AS1Q5SY13 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COL5A1-AS1Q5SY13 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COL5A1-AS1Q5SY13 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COL5A1-AS1Q5SY13 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COL5A1-AS1Q5SY13 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COL5A1-AS1Q5SY13 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COL5A1-AS1Q5SY13 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COL5A1-AS1Q5SY13 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COL5A1-AS1Q5SY13 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COL5A1-AS1Q5SY13 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COL5A1-AS1Q5SY13 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COL5A1-AS1Q5SY13 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COL5A1-AS1Q5SY13 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COL5A1-AS1Q5SY13 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COL5A1-AS1Q5SY13 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COL5A1-AS1Q5SY13 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COL5A1-AS1Q5SY13 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
COL5A1-AS1Q5SY13 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COL5A1-AS1Q5SY13 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COL5A1-AS1Q5SY13 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COL5A1-AS1Q5SY13 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COL5A1-AS1Q5SY13 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COL5A1-AS1Q5SY13 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COL5A1-AS1Q5SY13 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COL5A1-AS1Q5SY13 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COL5A1-AS1Q5SY13 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COL5A1-AS1Q5SY13 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COL5A1-AS1Q5SY13 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COL5A1-AS1Q5SY13 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COL5A1-AS1Q5SY13 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COL5A1-AS1Q5SY13 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COL5A1-AS1Q5SY13 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COL5A1-AS1Q5SY13 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COL5A1-AS1Q5SY13 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COL5A1-AS1Q5SY13 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COL5A1-AS1Q5SY13 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COL5A1-AS1Q5SY13 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COL5A1-AS1Q5SY13 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COL5A1-AS1Q5SY13 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COL5A1-AS1Q5SY13 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COL5A1-AS1Q5SY13 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COL5A1-AS1Q5SY13 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COL5A1-AS1Q5SY13 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COL5A1-AS1Q5SY13 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COL5A1-AS1Q5SY13 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms