Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE7

PHYHD1, Phytanoyl-CoA dioxygenase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHYHD1Q5SRE7 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PHYHD1Q5SRE7 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PHYHD1Q5SRE7 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PHYHD1Q5SRE7 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PHYHD1Q5SRE7 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PHYHD1Q5SRE7 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PHYHD1Q5SRE7 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PHYHD1Q5SRE7 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PHYHD1Q5SRE7 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PHYHD1Q5SRE7 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PHYHD1Q5SRE7 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PHYHD1Q5SRE7 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PHYHD1Q5SRE7 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PHYHD1Q5SRE7 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PHYHD1Q5SRE7 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PHYHD1Q5SRE7 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
PHYHD1Q5SRE7 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PHYHD1Q5SRE7 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PHYHD1Q5SRE7 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PHYHD1Q5SRE7 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PHYHD1Q5SRE7 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PHYHD1Q5SRE7 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PHYHD1Q5SRE7 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PHYHD1Q5SRE7 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PHYHD1Q5SRE7 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PHYHD1Q5SRE7 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PHYHD1Q5SRE7 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PHYHD1Q5SRE7 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PHYHD1Q5SRE7 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PHYHD1Q5SRE7 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PHYHD1Q5SRE7 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PHYHD1Q5SRE7 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PHYHD1Q5SRE7 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PHYHD1Q5SRE7 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PHYHD1Q5SRE7 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PHYHD1Q5SRE7 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PHYHD1Q5SRE7 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PHYHD1Q5SRE7 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PHYHD1Q5SRE7 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PHYHD1Q5SRE7 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PHYHD1Q5SRE7 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PHYHD1Q5SRE7 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PHYHD1Q5SRE7 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PHYHD1Q5SRE7 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PHYHD1Q5SRE7 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PHYHD1Q5SRE7 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PHYHD1Q5SRE7 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PHYHD1Q5SRE7 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PHYHD1Q5SRE7 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PHYHD1Q5SRE7 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PHYHD1Q5SRE7 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PHYHD1Q5SRE7 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PHYHD1Q5SRE7 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PHYHD1Q5SRE7 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PHYHD1Q5SRE7 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PHYHD1Q5SRE7 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PHYHD1Q5SRE7 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PHYHD1Q5SRE7 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PHYHD1Q5SRE7 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PHYHD1Q5SRE7 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PHYHD1Q5SRE7 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PHYHD1Q5SRE7 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PHYHD1Q5SRE7 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PHYHD1Q5SRE7 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PHYHD1Q5SRE7 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PHYHD1Q5SRE7 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PHYHD1Q5SRE7 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PHYHD1Q5SRE7 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PHYHD1Q5SRE7 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PHYHD1Q5SRE7 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PHYHD1Q5SRE7 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PHYHD1Q5SRE7 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PHYHD1Q5SRE7 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PHYHD1Q5SRE7 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PHYHD1Q5SRE7 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PHYHD1Q5SRE7 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PHYHD1Q5SRE7 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PHYHD1Q5SRE7 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PHYHD1Q5SRE7 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PHYHD1Q5SRE7 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PHYHD1Q5SRE7 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PHYHD1Q5SRE7 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PHYHD1Q5SRE7 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PHYHD1Q5SRE7 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PHYHD1Q5SRE7 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PHYHD1Q5SRE7 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PHYHD1Q5SRE7 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PHYHD1Q5SRE7 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PHYHD1Q5SRE7 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PHYHD1Q5SRE7 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PHYHD1Q5SRE7 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PHYHD1Q5SRE7 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PHYHD1Q5SRE7 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PHYHD1Q5SRE7 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PHYHD1Q5SRE7 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PHYHD1Q5SRE7 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PHYHD1Q5SRE7 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PHYHD1Q5SRE7 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PHYHD1Q5SRE7 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PHYHD1Q5SRE7 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms