Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZHG4

FNDC1, Fibronectin type III domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC1Q4ZHG4 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FNDC1Q4ZHG4 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FNDC1Q4ZHG4 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FNDC1Q4ZHG4 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FNDC1Q4ZHG4 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FNDC1Q4ZHG4 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FNDC1Q4ZHG4 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FNDC1Q4ZHG4 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FNDC1Q4ZHG4 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FNDC1Q4ZHG4 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FNDC1Q4ZHG4 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FNDC1Q4ZHG4 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FNDC1Q4ZHG4 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FNDC1Q4ZHG4 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FNDC1Q4ZHG4 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FNDC1Q4ZHG4 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FNDC1Q4ZHG4 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FNDC1Q4ZHG4 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FNDC1Q4ZHG4 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FNDC1Q4ZHG4 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FNDC1Q4ZHG4 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FNDC1Q4ZHG4 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FNDC1Q4ZHG4 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FNDC1Q4ZHG4 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FNDC1Q4ZHG4 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FNDC1Q4ZHG4 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FNDC1Q4ZHG4 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FNDC1Q4ZHG4 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FNDC1Q4ZHG4 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FNDC1Q4ZHG4 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FNDC1Q4ZHG4 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FNDC1Q4ZHG4 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FNDC1Q4ZHG4 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FNDC1Q4ZHG4 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FNDC1Q4ZHG4 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FNDC1Q4ZHG4 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FNDC1Q4ZHG4 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FNDC1Q4ZHG4 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
FNDC1Q4ZHG4 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FNDC1Q4ZHG4 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FNDC1Q4ZHG4 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FNDC1Q4ZHG4 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
FNDC1Q4ZHG4 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FNDC1Q4ZHG4 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FNDC1Q4ZHG4 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FNDC1Q4ZHG4 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FNDC1Q4ZHG4 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FNDC1Q4ZHG4 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FNDC1Q4ZHG4 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FNDC1Q4ZHG4 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FNDC1Q4ZHG4 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FNDC1Q4ZHG4 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FNDC1Q4ZHG4 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FNDC1Q4ZHG4 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FNDC1Q4ZHG4 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FNDC1Q4ZHG4 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FNDC1Q4ZHG4 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FNDC1Q4ZHG4 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FNDC1Q4ZHG4 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FNDC1Q4ZHG4 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FNDC1Q4ZHG4 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FNDC1Q4ZHG4 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FNDC1Q4ZHG4 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FNDC1Q4ZHG4 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FNDC1Q4ZHG4 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FNDC1Q4ZHG4 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FNDC1Q4ZHG4 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FNDC1Q4ZHG4 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FNDC1Q4ZHG4 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FNDC1Q4ZHG4 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FNDC1Q4ZHG4 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FNDC1Q4ZHG4 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FNDC1Q4ZHG4 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FNDC1Q4ZHG4 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FNDC1Q4ZHG4 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FNDC1Q4ZHG4 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FNDC1Q4ZHG4 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FNDC1Q4ZHG4 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
FNDC1Q4ZHG4 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FNDC1Q4ZHG4 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FNDC1Q4ZHG4 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FNDC1Q4ZHG4 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
FNDC1Q4ZHG4 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
FNDC1Q4ZHG4 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FNDC1Q4ZHG4 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FNDC1Q4ZHG4 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FNDC1Q4ZHG4 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FNDC1Q4ZHG4 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FNDC1Q4ZHG4 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FNDC1Q4ZHG4 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FNDC1Q4ZHG4 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FNDC1Q4ZHG4 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FNDC1Q4ZHG4 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FNDC1Q4ZHG4 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FNDC1Q4ZHG4 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FNDC1Q4ZHG4 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FNDC1Q4ZHG4 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FNDC1Q4ZHG4 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FNDC1Q4ZHG4 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FNDC1Q4ZHG4 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms