Protein–RNA interactions for Protein: Q496Y0

LONRF3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LONRF3Q496Y0 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LONRF3Q496Y0 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LONRF3Q496Y0 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LONRF3Q496Y0 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LONRF3Q496Y0 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LONRF3Q496Y0 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LONRF3Q496Y0 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LONRF3Q496Y0 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LONRF3Q496Y0 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LONRF3Q496Y0 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LONRF3Q496Y0 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LONRF3Q496Y0 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LONRF3Q496Y0 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LONRF3Q496Y0 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LONRF3Q496Y0 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LONRF3Q496Y0 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LONRF3Q496Y0 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LONRF3Q496Y0 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LONRF3Q496Y0 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LONRF3Q496Y0 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LONRF3Q496Y0 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LONRF3Q496Y0 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LONRF3Q496Y0 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LONRF3Q496Y0 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LONRF3Q496Y0 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
LONRF3Q496Y0 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LONRF3Q496Y0 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LONRF3Q496Y0 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LONRF3Q496Y0 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LONRF3Q496Y0 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LONRF3Q496Y0 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LONRF3Q496Y0 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LONRF3Q496Y0 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LONRF3Q496Y0 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LONRF3Q496Y0 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LONRF3Q496Y0 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LONRF3Q496Y0 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
LONRF3Q496Y0 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LONRF3Q496Y0 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
LONRF3Q496Y0 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
LONRF3Q496Y0 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
LONRF3Q496Y0 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
LONRF3Q496Y0 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LONRF3Q496Y0 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LONRF3Q496Y0 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LONRF3Q496Y0 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
LONRF3Q496Y0 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LONRF3Q496Y0 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LONRF3Q496Y0 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
LONRF3Q496Y0 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LONRF3Q496Y0 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LONRF3Q496Y0 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LONRF3Q496Y0 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LONRF3Q496Y0 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LONRF3Q496Y0 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LONRF3Q496Y0 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LONRF3Q496Y0 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LONRF3Q496Y0 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
LONRF3Q496Y0 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LONRF3Q496Y0 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LONRF3Q496Y0 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LONRF3Q496Y0 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LONRF3Q496Y0 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LONRF3Q496Y0 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LONRF3Q496Y0 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LONRF3Q496Y0 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LONRF3Q496Y0 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LONRF3Q496Y0 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LONRF3Q496Y0 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LONRF3Q496Y0 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LONRF3Q496Y0 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LONRF3Q496Y0 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LONRF3Q496Y0 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LONRF3Q496Y0 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
LONRF3Q496Y0 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LONRF3Q496Y0 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LONRF3Q496Y0 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LONRF3Q496Y0 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LONRF3Q496Y0 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
LONRF3Q496Y0 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LONRF3Q496Y0 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
LONRF3Q496Y0 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LONRF3Q496Y0 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LONRF3Q496Y0 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LONRF3Q496Y0 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LONRF3Q496Y0 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LONRF3Q496Y0 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LONRF3Q496Y0 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LONRF3Q496Y0 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LONRF3Q496Y0 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LONRF3Q496Y0 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
LONRF3Q496Y0 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
LONRF3Q496Y0 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LONRF3Q496Y0 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LONRF3Q496Y0 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LONRF3Q496Y0 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LONRF3Q496Y0 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LONRF3Q496Y0 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LONRF3Q496Y0 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LONRF3Q496Y0 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms