Protein–RNA interactions for Protein: Q494R4

CCDC153, Coiled-coil domain-containing protein 153, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC153Q494R4 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC153Q494R4 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC153Q494R4 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC153Q494R4 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC153Q494R4 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC153Q494R4 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC153Q494R4 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC153Q494R4 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC153Q494R4 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC153Q494R4 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC153Q494R4 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC153Q494R4 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC153Q494R4 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC153Q494R4 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC153Q494R4 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC153Q494R4 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC153Q494R4 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC153Q494R4 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC153Q494R4 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC153Q494R4 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC153Q494R4 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC153Q494R4 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC153Q494R4 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC153Q494R4 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC153Q494R4 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC153Q494R4 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC153Q494R4 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC153Q494R4 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC153Q494R4 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC153Q494R4 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC153Q494R4 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC153Q494R4 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC153Q494R4 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC153Q494R4 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC153Q494R4 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC153Q494R4 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC153Q494R4 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CCDC153Q494R4 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC153Q494R4 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC153Q494R4 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC153Q494R4 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC153Q494R4 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC153Q494R4 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC153Q494R4 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC153Q494R4 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC153Q494R4 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC153Q494R4 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC153Q494R4 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC153Q494R4 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC153Q494R4 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC153Q494R4 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC153Q494R4 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC153Q494R4 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC153Q494R4 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC153Q494R4 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC153Q494R4 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC153Q494R4 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC153Q494R4 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC153Q494R4 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC153Q494R4 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC153Q494R4 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC153Q494R4 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC153Q494R4 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC153Q494R4 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC153Q494R4 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC153Q494R4 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC153Q494R4 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC153Q494R4 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CCDC153Q494R4 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CCDC153Q494R4 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC153Q494R4 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC153Q494R4 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC153Q494R4 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC153Q494R4 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CCDC153Q494R4 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC153Q494R4 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC153Q494R4 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC153Q494R4 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC153Q494R4 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC153Q494R4 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC153Q494R4 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC153Q494R4 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CCDC153Q494R4 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CCDC153Q494R4 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC153Q494R4 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC153Q494R4 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC153Q494R4 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC153Q494R4 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC153Q494R4 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC153Q494R4 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CCDC153Q494R4 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC153Q494R4 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC153Q494R4 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC153Q494R4 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC153Q494R4 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC153Q494R4 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CCDC153Q494R4 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC153Q494R4 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CCDC153Q494R4 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC153Q494R4 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms