Protein–RNA interactions for Protein: Q3MI99

Ccbe1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccbe1Q3MI99 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccbe1Q3MI99 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccbe1Q3MI99 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccbe1Q3MI99 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccbe1Q3MI99 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccbe1Q3MI99 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccbe1Q3MI99 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccbe1Q3MI99 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccbe1Q3MI99 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccbe1Q3MI99 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccbe1Q3MI99 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccbe1Q3MI99 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccbe1Q3MI99 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccbe1Q3MI99 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccbe1Q3MI99 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccbe1Q3MI99 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccbe1Q3MI99 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccbe1Q3MI99 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccbe1Q3MI99 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccbe1Q3MI99 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccbe1Q3MI99 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccbe1Q3MI99 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccbe1Q3MI99 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccbe1Q3MI99 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccbe1Q3MI99 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccbe1Q3MI99 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccbe1Q3MI99 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccbe1Q3MI99 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccbe1Q3MI99 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccbe1Q3MI99 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccbe1Q3MI99 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccbe1Q3MI99 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccbe1Q3MI99 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccbe1Q3MI99 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccbe1Q3MI99 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccbe1Q3MI99 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccbe1Q3MI99 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccbe1Q3MI99 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccbe1Q3MI99 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccbe1Q3MI99 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccbe1Q3MI99 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccbe1Q3MI99 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccbe1Q3MI99 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccbe1Q3MI99 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccbe1Q3MI99 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccbe1Q3MI99 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccbe1Q3MI99 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccbe1Q3MI99 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccbe1Q3MI99 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccbe1Q3MI99 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccbe1Q3MI99 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccbe1Q3MI99 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccbe1Q3MI99 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccbe1Q3MI99 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccbe1Q3MI99 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccbe1Q3MI99 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccbe1Q3MI99 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccbe1Q3MI99 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccbe1Q3MI99 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccbe1Q3MI99 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccbe1Q3MI99 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccbe1Q3MI99 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccbe1Q3MI99 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccbe1Q3MI99 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccbe1Q3MI99 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccbe1Q3MI99 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccbe1Q3MI99 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccbe1Q3MI99 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccbe1Q3MI99 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccbe1Q3MI99 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccbe1Q3MI99 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccbe1Q3MI99 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccbe1Q3MI99 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccbe1Q3MI99 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccbe1Q3MI99 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccbe1Q3MI99 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccbe1Q3MI99 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccbe1Q3MI99 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccbe1Q3MI99 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccbe1Q3MI99 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccbe1Q3MI99 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccbe1Q3MI99 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccbe1Q3MI99 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccbe1Q3MI99 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccbe1Q3MI99 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ccbe1Q3MI99 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ccbe1Q3MI99 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccbe1Q3MI99 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccbe1Q3MI99 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccbe1Q3MI99 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccbe1Q3MI99 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccbe1Q3MI99 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccbe1Q3MI99 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccbe1Q3MI99 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccbe1Q3MI99 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccbe1Q3MI99 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccbe1Q3MI99 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccbe1Q3MI99 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccbe1Q3MI99 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccbe1Q3MI99 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms