Protein–RNA interactions for Protein: Q3LFD5

USP41, Putative ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 41, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP41Q3LFD5 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP41Q3LFD5 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP41Q3LFD5 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP41Q3LFD5 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP41Q3LFD5 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP41Q3LFD5 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
USP41Q3LFD5 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP41Q3LFD5 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP41Q3LFD5 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP41Q3LFD5 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
USP41Q3LFD5 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP41Q3LFD5 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP41Q3LFD5 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP41Q3LFD5 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP41Q3LFD5 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP41Q3LFD5 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP41Q3LFD5 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP41Q3LFD5 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP41Q3LFD5 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP41Q3LFD5 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP41Q3LFD5 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP41Q3LFD5 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP41Q3LFD5 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP41Q3LFD5 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP41Q3LFD5 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP41Q3LFD5 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
USP41Q3LFD5 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP41Q3LFD5 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP41Q3LFD5 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP41Q3LFD5 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP41Q3LFD5 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP41Q3LFD5 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP41Q3LFD5 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP41Q3LFD5 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP41Q3LFD5 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
USP41Q3LFD5 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP41Q3LFD5 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP41Q3LFD5 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP41Q3LFD5 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP41Q3LFD5 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP41Q3LFD5 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP41Q3LFD5 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP41Q3LFD5 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP41Q3LFD5 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP41Q3LFD5 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP41Q3LFD5 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP41Q3LFD5 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP41Q3LFD5 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP41Q3LFD5 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP41Q3LFD5 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP41Q3LFD5 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP41Q3LFD5 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP41Q3LFD5 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP41Q3LFD5 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP41Q3LFD5 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP41Q3LFD5 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP41Q3LFD5 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP41Q3LFD5 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP41Q3LFD5 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP41Q3LFD5 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP41Q3LFD5 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP41Q3LFD5 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP41Q3LFD5 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP41Q3LFD5 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP41Q3LFD5 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP41Q3LFD5 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP41Q3LFD5 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP41Q3LFD5 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
USP41Q3LFD5 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP41Q3LFD5 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP41Q3LFD5 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP41Q3LFD5 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP41Q3LFD5 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP41Q3LFD5 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP41Q3LFD5 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP41Q3LFD5 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP41Q3LFD5 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP41Q3LFD5 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP41Q3LFD5 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP41Q3LFD5 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP41Q3LFD5 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP41Q3LFD5 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP41Q3LFD5 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP41Q3LFD5 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP41Q3LFD5 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP41Q3LFD5 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP41Q3LFD5 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP41Q3LFD5 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP41Q3LFD5 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
USP41Q3LFD5 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP41Q3LFD5 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP41Q3LFD5 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP41Q3LFD5 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP41Q3LFD5 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
USP41Q3LFD5 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
USP41Q3LFD5 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
USP41Q3LFD5 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC23■■□□□ 1.27
USP41Q3LFD5 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
USP41Q3LFD5 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
USP41Q3LFD5 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms