Protein–RNA interactions for Protein: Q2M243

CCDC27, Coiled-coil domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC27Q2M243 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC27Q2M243 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC27Q2M243 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC27Q2M243 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC27Q2M243 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC27Q2M243 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC27Q2M243 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC27Q2M243 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC27Q2M243 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC27Q2M243 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC27Q2M243 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC27Q2M243 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC27Q2M243 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC27Q2M243 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC27Q2M243 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC27Q2M243 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC27Q2M243 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC27Q2M243 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC27Q2M243 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
CCDC27Q2M243 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC27Q2M243 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC27Q2M243 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC27Q2M243 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC27Q2M243 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC27Q2M243 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC27Q2M243 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC27Q2M243 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC27Q2M243 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC27Q2M243 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC27Q2M243 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC27Q2M243 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC27Q2M243 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC27Q2M243 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC27Q2M243 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC27Q2M243 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC27Q2M243 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC27Q2M243 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC27Q2M243 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC27Q2M243 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC27Q2M243 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC27Q2M243 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC27Q2M243 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC27Q2M243 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC27Q2M243 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC27Q2M243 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC27Q2M243 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC27Q2M243 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC27Q2M243 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC27Q2M243 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC27Q2M243 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC27Q2M243 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC27Q2M243 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC27Q2M243 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC27Q2M243 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC27Q2M243 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC27Q2M243 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC27Q2M243 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC27Q2M243 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC27Q2M243 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC27Q2M243 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC27Q2M243 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC27Q2M243 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC27Q2M243 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC27Q2M243 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC27Q2M243 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC27Q2M243 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC27Q2M243 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC27Q2M243 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC27Q2M243 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC27Q2M243 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC27Q2M243 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC27Q2M243 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC27Q2M243 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC27Q2M243 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC27Q2M243 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC27Q2M243 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC27Q2M243 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC27Q2M243 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC27Q2M243 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC27Q2M243 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC27Q2M243 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC27Q2M243 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC27Q2M243 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC27Q2M243 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC27Q2M243 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC27Q2M243 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC27Q2M243 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC27Q2M243 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC27Q2M243 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC27Q2M243 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC27Q2M243 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC27Q2M243 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC27Q2M243 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC27Q2M243 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC27Q2M243 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC27Q2M243 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC27Q2M243 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC27Q2M243 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC27Q2M243 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC27Q2M243 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms