Protein–RNA interactions for Protein: Q29980

MICB, MHC class I polypeptide-related sequence B, humanhuman

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MICBQ29980 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
MICBQ29980 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MICBQ29980 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MICBQ29980 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
MICBQ29980 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MICBQ29980 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
MICBQ29980 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MICBQ29980 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
MICBQ29980 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MICBQ29980 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MICBQ29980 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MICBQ29980 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MICBQ29980 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MICBQ29980 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
MICBQ29980 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MICBQ29980 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
MICBQ29980 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
MICBQ29980 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
MICBQ29980 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
MICBQ29980 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MICBQ29980 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
MICBQ29980 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MICBQ29980 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MICBQ29980 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
MICBQ29980 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
MICBQ29980 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MICBQ29980 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MICBQ29980 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MICBQ29980 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MICBQ29980 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MICBQ29980 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MICBQ29980 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MICBQ29980 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MICBQ29980 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MICBQ29980 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MICBQ29980 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MICBQ29980 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MICBQ29980 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MICBQ29980 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MICBQ29980 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MICBQ29980 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MICBQ29980 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MICBQ29980 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
MICBQ29980 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MICBQ29980 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MICBQ29980 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MICBQ29980 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MICBQ29980 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MICBQ29980 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MICBQ29980 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MICBQ29980 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
MICBQ29980 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MICBQ29980 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MICBQ29980 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MICBQ29980 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
MICBQ29980 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MICBQ29980 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MICBQ29980 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
MICBQ29980 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MICBQ29980 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MICBQ29980 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MICBQ29980 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MICBQ29980 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MICBQ29980 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MICBQ29980 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
MICBQ29980 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MICBQ29980 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MICBQ29980 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MICBQ29980 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MICBQ29980 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MICBQ29980 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MICBQ29980 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MICBQ29980 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MICBQ29980 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MICBQ29980 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MICBQ29980 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MICBQ29980 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MICBQ29980 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MICBQ29980 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
MICBQ29980 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MICBQ29980 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MICBQ29980 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
MICBQ29980 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MICBQ29980 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MICBQ29980 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MICBQ29980 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MICBQ29980 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MICBQ29980 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MICBQ29980 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MICBQ29980 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MICBQ29980 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MICBQ29980 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MICBQ29980 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MICBQ29980 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
MICBQ29980 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MICBQ29980 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MICBQ29980 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MICBQ29980 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MICBQ29980 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MICBQ29980 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms